SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Kerkhoven Eduard 1985)
 

Sökning: WFRF:(Kerkhoven Eduard 1985) > Evaluating accessib...

Evaluating accessibility, usability and interoperability of genome-scale metabolic models for diverse yeasts species

Domenzain Del Castillo Cerecer, Iván, 1991 (författare)
Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
Li, Feiran, 1993 (författare)
Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
Kerkhoven, Eduard, 1985 (författare)
Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
visa fler...
Siewers, Verena, 1976 (författare)
Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2021-01-11
2021
Engelska.
Ingår i: FEMS Yeast Research. - : Oxford University Press (OUP). - 1567-1356 .- 1567-1364. ; 21:1
  • Forskningsöversikt (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Metabolic network reconstructions have become an important tool for probing cellular metabolism in the field of systems biology. They are used as tools for quantitative prediction but also as scaffolds for further knowledge contextualization. The yeast Saccharomyces cerevisiae was one of the first organisms for which a genome-scale metabolic model (GEM) was reconstructed, in 2003, and since then 45 metabolic models have been developed for a wide variety of relevant yeasts species. A systematic evaluation of these models revealed that-despite this long modeling history-the sequential process of tracing model files, setting them up for basic simulation purposes and comparing them across species and even different versions, is still not a generalizable task. These findings call the yeast modeling community to comply to standard practices on model development and sharing in order to make GEMs accessible and useful for a wider public.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap -- Annan data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences -- Other Computer and Information Science (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Elektroteknik och elektronik -- Datorsystem (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Electrical Engineering, Electronic Engineering, Information Engineering -- Computer Systems (hsv//eng)

Nyckelord

yeast species
systems biology
accessibility
usability
interoperability
genome-scale metabolic models

Publikations- och innehållstyp

for (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy