A Genome-Wide Association Study of Monozygotic Twin-Pairs Suggests a Locus Related to Variability of Serum High-Density Lipoprotein Cholesterol

Genome-wide association analysis on monozygotic twin-pairs offers a route to discovery of gene-environment interactions through testing for variability loci associated with sensitivity to individual environment/lifestyle. We present a genome-wide scan of loci associated with intra-pair differences in serum lipid and apolipoprotein levels. We report data for 1,720 monozygotic female twin-pairs from GenomEUtwin project with 2.5 million SNPs, imputed or genotyped, and measured serum lipid fractions for both twins. We found one locus associated with intra-pair differences in high-density lipoprotein cholesterol, rs2483058 in an intron of SRGAP2, where twins carrying the C allele are more sensitive to environmental factors (P = 3.98 × 10-8). We followed up the association in further genotyped monozygotic twins (N = 1,261), which showed a moderate association for the variant (P = 0.200, same direction of an effect). In addition, we report a new association on the level of apolipoprotein A-II (P = 4.03 × 10-8).

Whitfield, John B (författare)
Perola, Markus (författare)
Visscher, Peter M (författare)
Montgomery, Grant W (författare)
Falchi, Mario (författare)
Willemsen, Gonneke (författare)
de Geus, Eco J C (författare)
Magnusson, Patrik K EKarolinska Institutet (författare)
Christensen, Kaare (författare)
Sørensen, Thorkild I A (författare)
Pietiläinen, Kirsi H (författare)
Rantanen, Taina (författare)
Silander, Kaisa (författare)
Widén, Elisabeth (författare)
Muilu, Juha (författare)
Rahman, IffatKarolinska Institutet (författare)
Liljedahl, Ulrika (författare)
Syvänen, Ann-ChristineUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)anncsyva (författare)
Palotie, Aarno (författare)
Kaprio, Jaakko (författare)
Kyvik, Kirsten O (författare)
Pedersen, Nancy LKarolinska Institutet (författare)
Boomsma, Dorret I (författare)
Spector, Tim (författare)
Martin, Nicholas G (författare)
Ripatti, Samuli (författare)
Peltonen, Leena (författare)
Karolinska InstitutetMolekylär medicin (creator_code:org_t)

Ingår i:Twin Research and Human Genetics: Cambridge University Press (CUP)15:6, s. 691-6991832-42741839-2628

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.