SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Karlsson Jacob)
 

Sökning: WFRF:(Karlsson Jacob) > Hierarchical Cluste...

  • Johansson, EmilLund University,Lunds universitet,HIV-1 och HIV-2 värd interaktioner,Forskargrupper vid Lunds universitet,HIV-1 and HIV-2 host interactions,Lund University Research Groups (författare)

Hierarchical Clustering and Trajectory Analyses Reveal Viremia-Independent B-Cell Perturbations in HIV-2 Infection

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-10-06
  • MDPI,2022
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-203257
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-203257URI
  • https://doi.org/10.3390/cells11193142DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:150930993URI
  • https://lup.lub.lu.se/record/91a6600e-b17f-47eb-a090-cdd005770c9cURI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Time to AIDS in HIV-2 infection is approximately twice as long compared to in HIV-1 infection. Despite reduced viremia, HIV-2-infected individuals display signs of chronic immune activation. In HIV-1-infected individuals, B-cell hyperactivation is driven by continuous antigen exposure. However, the contribution of viremia to B-cell perturbations in HIV-2-infected individuals remains largely unexplored. Here, we used polychromatic flow cytometry, consensus hierarchical clustering and pseudotime trajectory inference to characterize B-cells in HIV-1- or HIV-2-infected and in HIV seronegative individuals. We observed increased frequencies of clusters containing hyperactivated T-bethighCD95highCD27int and proliferating T-bet+CD95highCD27+CD71+ memory B-cells in viremic HIV-1 (p < 0.001 and p < 0.001, respectively), viremic HIV-2 (p < 0.001 and p = 0.014, respectively) and in treatment-naïve aviremic HIV-2 (p = 0.004 and p = 0.020, respectively)-infected individuals, compared to seronegative individuals. In contrast, these expansions were not observed in successfully treated HIV-1-infected individuals. Finally, pseudotime trajectory inference showed that T-bet-expressing hyperactivated and proliferating memory B-cell populations were located at the terminal end of two trajectories, in both HIV-1 and HIV-2 infections. As the treatment-naïve aviremic HIV-2-infected individuals, but not the successfully ART-treated HIV-1-infected individuals, showed B-cell perturbations, our data suggest that aviremic HIV-2-infected individuals would also benefit from antiretroviral treatment.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Kerkman, PriscillaUmeå University,Umeå universitet,Institutionen för klinisk mikrobiologi,Department of Medical Microbiology, University Medical Center Utrecht, Utrecht, Netherlands(Swepub:umu)prke0003 (författare)
  • Scharf, LydiaKarolinska Institute (författare)
  • Lindman, JacobLund University,Lunds universitet,Infektionsmedicin,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Infection Medicine (BMC),Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-jl_ (författare)
  • Szojka, Zsófia I.Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för medicinsk mikrobiologi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Medical Microbiology,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)zs3365sz (författare)
  • Månsson, FredrikLund University,Lunds universitet,Klinisk infektionsmedicin,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical infection medicine,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mmb-fma (författare)
  • Biague, AntonioNational Laboratory for Public Health, Bissau, Guinea-Bissau (författare)
  • Medstrand, PatrikLund University,Lunds universitet,Klinisk virologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Virology, Malmö,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mmb-pme (författare)
  • Norrgren, HansLund University,Lunds universitet,Infektionsmedicin,Sektion III,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Infection Medicine (BMC),Section III,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)infek-hn (författare)
  • Buggert, MarcusKarolinska Institute,Karolinska Institutet (författare)
  • Karlsson, Annika C.Karolinska Institute,Karolinska Institutet (författare)
  • Forsell, Mattias N. E.Umeå University,Umeå universitet,Institutionen för klinisk mikrobiologi(Swepub:umu)mafo0173 (författare)
  • Esbjörnsson, JoakimLund University,Lunds universitet,Systemvirologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Systems Virology,Lund University Research Groups,University of Oxford(Swepub:lu)med-jes (författare)
  • Jansson, MarianneLund University,Lunds universitet,HIV-1 och HIV-2 värd interaktioner,Forskargrupper vid Lunds universitet,HIV-1 and HIV-2 host interactions,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mmb-mj0 (författare)
  • HIV-1 och HIV-2 värd interaktionerForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)
  • SWEGUB CORE group

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Cells: MDPI11:192073-4409

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Cells (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy