WFRF:(Catrina Anca)
Sökning: WFRF:(Catrina Anca) > T cells are influen...
- 26 av 53
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Houtman, MirandaKarolinska Institutet (författare)
T cells are influenced by a long non-coding RNA in the autoimmune associated PTPN2 locus
- Artikel/kapitelEngelska2018
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD,2018
- electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-357383
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-357383URI
- https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003DOI
- http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:138396170URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Non-coding SNPs in the protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2) locus have been linked with several autoimmune diseases, including rheumatoid arthritis, type I diabetes, and inflammatory bowel disease. However, the functional consequences of these SNPs are poorly characterized. Herein, we show in blood cells that SNPs in the PTPN2 locus are highly correlated with DNA methylation levels at four CpG sites downstream of PTPN2 and expression levels of the long non-coding RNA (IncRNA) LINC01882 downstream of these CpG sites. We observed that LINC01882 is mainly expressed in T cells and that anti-CD3/CD28 activated naive CD4(+) T cells downregulate the expression of LINC01882. RNA sequencing analysis of LINC01882 knockdown in Jurkat T cells, using a combination of antisense oligo-nucleotides and RNA interference, revealed the upregulation of the transcription factor ZEB1 and kinase MAP2K4, both involved in IL-2 regulation. Overall, our data suggests the involvement of LINC01882 in T cell activation and hints towards an auxiliary role of these non-coding SNPs in autoimmunity associated with the PTPN2 locus.
Ämnesord och genrebeteckningar
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Reumatologi och inflammation hsv//swe
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Rheumatology and Autoimmunity hsv//eng
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Cell- och molekylärbiologi hsv//swe
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Cell and Molecular Biology hsv//eng
- RA
- Genome-wide association
- methQTL
- eQTL
- Long non-coding RNA
- T cell
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Shchetynsky, KlementyKarolinska Institutet (författare)
- Chemin, KarineKarolinska Institutet (författare)
- Hensvold, Aase HajKarolinska Institutet (författare)
- Ramsköld, DanielKarolinska Institutet (författare)
- Tandre, KarolinaUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)karotand (författare)
- Eloranta, Maija-LeenaUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)maelo020 (författare)
- Rönnblom, LarsUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)larsronn (författare)
- Uebe, SteffenUniv Erlangen Nurnberg, Inst Human Genet, Erlangen, Germany (författare)
- Catrina, Anca IrinelKarolinska Institutet (författare)
- Malmström, VivianneKarolinska Institutet (författare)
- Padyukov, LeonidKarolinska Institutet (författare)
- Karolinska InstitutetReumatologi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Journal of Autoimmunity: ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD90, s. 28-380896-84111095-9157
Internetlänk
- https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003Fulltext
- https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1241617/FULLTEXT01.pdffulltext:print
- https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-357383
- https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003
- http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:138396170
Hitta via bibliotek
- Journal of Autoimmunity (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 26 av 53
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Houtman, Miranda
- Shchetynsky, Kle ...
- Chemin, Karine
- Hensvold, Aase H ...
- Ramsköld, Daniel
- Tandre, Karolina
- visa fler...
- Eloranta, Maija- ...
- Rönnblom, Lars
- Uebe, Steffen
- Catrina, Anca Ir ...
- Malmström, Vivia ...
- Padyukov, Leonid
- visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Klinisk medicin
- och Reumatologi och ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Medicinska och f ...
- och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
- Journal of Autoi ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
- Karolinska Institutet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
