SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Catrina Anca)
 

Sökning: WFRF:(Catrina Anca) > T cells are influen...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00004241naa a2200577 4500
001oai:DiVA.org:uu-357383
003SwePub
008180824s2018 | |||||||||||000 ||eng|
009oai:prod.swepub.kib.ki.se:138396170
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-3573832 URI
0247 a https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.0032 DOI
0247 a http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:1383961702 URI
040 a (SwePub)uud (SwePub)ki
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Houtman, Mirandau Karolinska Institutet4 aut
2451 0a T cells are influenced by a long non-coding RNA in the autoimmune associated PTPN2 locus
264 1b ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD,c 2018
338 a electronic2 rdacarrier
520 a Non-coding SNPs in the protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2) locus have been linked with several autoimmune diseases, including rheumatoid arthritis, type I diabetes, and inflammatory bowel disease. However, the functional consequences of these SNPs are poorly characterized. Herein, we show in blood cells that SNPs in the PTPN2 locus are highly correlated with DNA methylation levels at four CpG sites downstream of PTPN2 and expression levels of the long non-coding RNA (IncRNA) LINC01882 downstream of these CpG sites. We observed that LINC01882 is mainly expressed in T cells and that anti-CD3/CD28 activated naive CD4(+) T cells downregulate the expression of LINC01882. RNA sequencing analysis of LINC01882 knockdown in Jurkat T cells, using a combination of antisense oligo-nucleotides and RNA interference, revealed the upregulation of the transcription factor ZEB1 and kinase MAP2K4, both involved in IL-2 regulation. Overall, our data suggests the involvement of LINC01882 in T cell activation and hints towards an auxiliary role of these non-coding SNPs in autoimmunity associated with the PTPN2 locus. 
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Reumatologi och inflammation0 (SwePub)302102 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Rheumatology and Autoimmunity0 (SwePub)302102 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Cell- och molekylärbiologi0 (SwePub)301082 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Cell and Molecular Biology0 (SwePub)301082 hsv//eng
653 a RA
653 a Genome-wide association
653 a methQTL
653 a eQTL
653 a Long non-coding RNA
653 a T cell
7001 a Shchetynsky, Klementyu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Chemin, Karineu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Hensvold, Aase Haju Karolinska Institutet4 aut
7001 a Ramsköld, Danielu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Tandre, Karolinau Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:uu)karotand
7001 a Eloranta, Maija-Leenau Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:uu)maelo020
7001 a Rönnblom, Larsu Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab4 aut0 (Swepub:uu)larsronn
7001 a Uebe, Steffenu Univ Erlangen Nurnberg, Inst Human Genet, Erlangen, Germany4 aut
7001 a Catrina, Anca Irinelu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Malmström, Vivianneu Karolinska Institutet4 aut
7001 a Padyukov, Leonidu Karolinska Institutet4 aut
7102 a Karolinska Institutetb Reumatologi4 org
7730 t Journal of Autoimmunityd : ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTDg 90, s. 28-38q 90<28-38x 0896-8411x 1095-9157
8564 u https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003y Fulltext
8564 u https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1241617/FULLTEXT01.pdfx primaryx Raw objecty fulltext:print
8564 u https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-357383
8564 8u https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003
8564 8u http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:138396170

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy