Sökning: L773:1097 0134 OR L773:0887 3585 >
Methods for estimat...
Methods for estimation of model accuracy in CASP12
-
- Elofsson, Arne (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sweden
-
- Joo, Keehyoung (författare)
- Korea Inst Adv Study, South Korea
-
- Keasar, Chen (författare)
- Ben Gurion Univ Negev, Israel
-
visa fler...
-
- Lee, Jooyoung (författare)
- Korea Inst Adv Study, South Korea
-
- Maghrabi, Ali H. A. (författare)
- Univ Reading, England
-
- Manavalan, Balachandran (författare)
- Korea Inst Adv Study, South Korea
-
- McGuffin, Liam J. (författare)
- Univ Reading, England
-
- Menéndez Hurtado, David (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sweden
-
- Mirabello, Claudio (författare)
- Linköpings universitet,Bioinformatik,Tekniska fakulteten
-
- Pilstål, Robert (författare)
- Linköpings universitet,Bioinformatik,Tekniska fakulteten
-
- Sidi, Tomer (författare)
- Ben Gurion Univ Negev, Israel
-
- Uziela, Karolis (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sweden
-
- Wallner, Björn (författare)
- Linköpings universitet,Bioinformatik,Tekniska fakulteten
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-10-17
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Proteins. - : Wiley. - 0887-3585 .- 1097-0134. ; 86:S1, s. 361-373
- Relaterad länk:
-
http://centaur.readi...
-
visa fler...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Methods to reliably estimate the quality of 3D models of proteins are essential drivers for the wide adoption and serious acceptance of protein structure predictions by life scientists. In this article, the most successful groups in CASP12 describe their latest methods for estimates of model accuracy (EMA). We show that pure single model accuracy estimation methods have shown clear progress since CASP11; the 3 top methods (MESHI, ProQ3, SVMQA) all perform better than the top method of CASP11 (ProQ2). Although the pure single model accuracy estimation methods outperform quasi-single (ModFOLD6 variations) and consensus methods (Pcons, ModFOLDclust2, Pcomb-domain, and Wallner) in model selection, they are still not as good as those methods in absolute model quality estimation and predictions of local quality. Finally, we show that when using contact-based model quality measures (CAD, lDDT) the single model quality methods perform relatively better.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
Nyckelord
- CASP
- consensus predictions
- estimates of model accuracy
- machine learning
- protein structure prediction
- quality assessment
- Biochemistry towards Bioinformatics
- biokemi med inriktning mot bioinformatik
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
-
Proteins
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Elofsson, Arne
-
Joo, Keehyoung
-
Keasar, Chen
-
Lee, Jooyoung
-
Maghrabi, Ali H. ...
-
Manavalan, Balac ...
-
visa fler...
-
McGuffin, Liam J ...
-
Menéndez Hurtado ...
-
Mirabello, Claud ...
-
Pilstål, Robert
-
Sidi, Tomer
-
Uziela, Karolis
-
Wallner, Björn
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
- Artiklar i publikationen
-
Proteins
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Linköpings universitet