Proteotyping for Rapid Identifications of Clinically-Relevant Infectious Bacteria

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Gonzales Siles Lucia) > Proteotyping for Ra...

Proteotyping for Rapid Identifications of Clinically-Relevant Infectious Bacteria

Salvà-Serra, Francisco, 1989 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

Jakobsson, Hedvig E (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

Gonzales-Siles, Lucia (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

visa fler...

Karlsson, Roger, 1975 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

Boulund, Fredrik, 1985 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics

Jaén-Luchoro, Daniel (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

Bennasar-Figueras, A (författare)

Kristiansson, Erik, 1978 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics

Moore, Edward R.B. 1954 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine

visa färre...

(creator_code:org_t)

2016
2016
Engelska.
Ingår i: Programme of the XXXV ECCO Meeting 2016.

Relaterad länk:: https://gup.ub.gu.se...

Konferensbidrag (övrigt vetenskapligt/konstnärligt)

Abstract Ämnesord

Stäng

Aims The development and application of novel identifications and diagnostics of pathogenic bacteria, virulence and antibiotic resistance factors, to enhance treatment of infectious diseases and to address the pandemic of antimicrobial resistance (1). To apply mass spectrometry (MS)-based ‘proteotyping’, a rapid proteomic-genomic method to identify and use cell biomarkers for pathogen identification and detection of targeted metabolic functions (www.tailored-treatment.eu/). Methods and results The proteins of intact bacterial cells or cell-fractions are bound to a membrane surface, using the patented (WO2006068619) Lipid-based Protein Immobilization (LPI) technology. Peptides are generated from bound proteins, using enzymatic digestion, separated and analyzed by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). The MS profiles are compared to those of reference peptide sequences and the peptide sequences are compared against a curated in-house database of genome sequences. Conclusions Analyses of bacterial cell peptides identified protein biomarkers of infectious bacteria, at the species-level, virulence and antibiotic resistance factors. Model samples have been ‘proteotyped’, using well-characterized reference strains, and an enhanced whole-genome sequence database, to demonstrate ‘proof-of-concept’, and the method been applied directly to the analyses of clinical samples, without prior cultivation. Significance of study Proteotyping demonstrates the potential for proteomics-based analyses for detecting expressed genomic markers of bacterial species, virulence and antibiotic resistance, for the identifications and diagnostics of infectious microorganisms. References Cohen A, Bont L, Engelhard D, Moore E, Fernández D, Kreisberg-Greenblatt R, Oved K, Eden E, Hayes J (2015). A multifaceted 'omics' approach for addressing the challenge of antimicrobial resistance. Future Microbiol. 10:365-376

Ämnesord

NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biologisk systematik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biological Systematics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

vet (ämneskategori)
kon (ämneskategori)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Salvà-Serra, Fra ...; Jakobsson, Hedvi ...; Gonzales-Siles, ...; Karlsson, Roger, ...; Boulund, Fredrik ...; Jaén-Luchoro, Da ...; visa fler...; Bennasar-Figuera ...; Kristiansson, Er ...; Moore, Edward R. ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biologisk system ...

Artiklar i publikationen: Programme of the ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se