SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Vrána Jan)
 

Sökning: WFRF:(Vrána Jan) > Construction of a m...

  • Beier, SebastianLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)

Construction of a map-based reference genome sequence for barley, Hordeum vulgare L.

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-04-27
  • Springer Science and Business Media LLC,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:9ba2fa50-a7d6-4f07-a932-dc05e72d79e5
  • https://lup.lub.lu.se/record/9ba2fa50-a7d6-4f07-a932-dc05e72d79e5URI
  • https://doi.org/10.1038/sdata.2017.44DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Barley (Hordeum vulgare L.) is a cereal grass mainly used as animal fodder and raw material for the malting industry. The map-based reference genome sequence of barley cv. â € Morex' was constructed by the International Barley Genome Sequencing Consortium (IBSC) using hierarchical shotgun sequencing. Here, we report the experimental and computational procedures to (i) sequence and assemble more than 80,000 bacterial artificial chromosome (BAC) clones along the minimum tiling path of a genome-wide physical map, (ii) find and validate overlaps between adjacent BACs, (iii) construct 4,265 non-redundant sequence scaffolds representing clusters of overlapping BACs, and (iv) order and orient these BAC clusters along the seven barley chromosomes using positional information provided by dense genetic maps, an optical map and chromosome conformation capture sequencing (Hi-C). Integrative access to these sequence and mapping resources is provided by the barley genome explorer (BARLEX).

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Himmelbach, AxelLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Colmsee, ChristianLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Zhang, Xiao QiMurdoch University (författare)
  • Barrero, Roberto A.Murdoch University (författare)
  • Zhang, QisenAustralian Export Grains Innovation Centre (författare)
  • Li, LinUniversity of Minnesota (författare)
  • Bayer, MichaJames Hutton Institute (författare)
  • Bolser, DanielEuropean Bioinformatics Institute (författare)
  • Taudien, StefanLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
  • Groth, MarcoLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
  • Felder, MariusLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
  • Hastie, AlexBioNano Genomics Inc. (författare)
  • Šimková, HanaAcademy of Sciences of the Czech Republic (författare)
  • Staňková, HelenaAcademy of Sciences of the Czech Republic (författare)
  • Vrána, JanAcademy of Sciences of the Czech Republic (författare)
  • Chan, SakiBioNano Genomics Inc. (författare)
  • Muñoz-Amatriaín, MaríaUniversity of California, Riverside (författare)
  • Ounit, RachidUniversity of California, Riverside (författare)
  • Wanamaker, SteveUniversity of California, Riverside (författare)
  • Schmutzer, ThomasLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Aliyeva-Schnorr, LalaLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Grasso, StefanoUniversity of Udine (författare)
  • Tanskanen, JaakkoUniversity of Helsinki (författare)
  • Sampath, DharanyaEarlham Institute (författare)
  • Heavens, DarrenEarlham Institute (författare)
  • Cao, SujieBeijing Genomics Institute (författare)
  • Chapman, BrettMurdoch University (författare)
  • Dai, FeiZhejiang University (författare)
  • Han, YongZhejiang University (författare)
  • Li, HuaBeijing Genomics Institute (författare)
  • Li, XuanBeijing Genomics Institute (författare)
  • Lin, ChongyunBeijing Genomics Institute (författare)
  • McCooke, John K.Murdoch University (författare)
  • Tan, CongMurdoch University (författare)
  • Wang, SongboBeijing Genomics Institute (författare)
  • Yin, ShuyaZhejiang University (författare)
  • Zhou, GaofengMurdoch University (författare)
  • Poland, Jesse A.Kansas State University (författare)
  • Bellgard, Matthew I.Murdoch University (författare)
  • Houben, AndreasLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Doležel, JaroslavAcademy of Sciences of the Czech Republic (författare)
  • Ayling, SarahEarlham Institute (författare)
  • Lonardi, StefanoUniversity of California, Riverside (författare)
  • Langridge, PeterUniversity of Adelaide (författare)
  • Muehlbauer, Gary J.University of Minnesota (författare)
  • Kersey, PaulEuropean Bioinformatics Institute (författare)
  • Clark, Matthew D.Earlham Institute,University of East Anglia (författare)
  • Caccamo, MarioNational Institute of Agricultural Botany,Earlham Institute (författare)
  • Schulman, Alan H.University of Helsinki (författare)
  • Platzer, MatthiasLeibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI) (författare)
  • Close, Timothy J.University of California, Riverside (författare)
  • Hansson, MatsLund University,Lunds universitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Department of Biology,Faculty of Science(Swepub:lu)biok-mha (författare)
  • Zhang, GuopingZhejiang University (författare)
  • Braumann, IlkaCarlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory (författare)
  • Li, ChengdaoDepartment of Agriculture and Food Western Australia,Murdoch University,Yangtze University (författare)
  • Waugh, RobbieJames Hutton Institute,University of Dundee (författare)
  • Scholz, UweLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (författare)
  • Stein, NilsLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research,University of Western Australia, Crawley (författare)
  • Mascher, MartinLeibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research,German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv) (författare)
  • Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant ResearchMurdoch University (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Scientific Data: Springer Science and Business Media LLC42052-4463

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy