SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ramesh B)
 

Sökning: WFRF:(Ramesh B) > (2015-2019) > The Mycobacterium p...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003603naa a2200433 4500
001oai:DiVA.org:uu-298249
003SwePub
008160701s2016 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-2982492 URI
0247 a https://doi.org/10.1093/gbe/evw0492 DOI
040 a (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Das, Sarbashisu Uppsala universitet,Kemisk biologi4 aut0 (Swepub:uu)sarda235
2451 0a The Mycobacterium phlei Genome :b Expectations and Surprises
264 c 2016-03-03
264 1b Oxford University Press (OUP),c 2016
338 a electronic2 rdacarrier
520 a Mycobacterium phlei, a nontuberculosis mycobacterial species, was first described in 1898-1899. We present the complete genome sequence for the IV, phlei CCUG21000(T) type strain and the draft genomes for four additional strains. The genome size for all five is 5.3 Mb with 69.4% Guanine-Cytosine content. This is approximate to 0.35 Mbp smaller than the previously reported M. phlei RIVM draft genome. The size difference is attributed partly to large bacteriophage sequence fragments in the M. phlei RIVM genome. Comparative analysis revealed the following: 1) A CRISPR system similar to Type 1E (cas3) in M. phiei RIVM; 2) genes involved in polyamine metabolism and transport (potAD, potT) that are absent in other mycobacteria, and 3) strain specific variations in the number of sigma-factor genes. Moreover, M. phlei has as many as 82 mce (mammalian cell entry) homologs and many of the horizontally acquired genes in M. phlei are present in other environmental bacteria including mycobacteria that share similar habitat. Phylogenetic analysis based on 693 Mycobacterium core genes present in all complete mycobacterial genomes suggested that its closest neighbor is Mycobacterium smegmatis JS623 and Mycobacterium rhodesiae NBB3, while it is more distant to M. smegmatis mc2 155.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Medicinsk genetik0 (SwePub)301072 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Medical Genetics0 (SwePub)301072 hsv//eng
653 a Mycobacterium phlei genome sequence
653 a mycobacterial growth
653 a comparative genome analysis
653 a mycobacterial phylogeny
7001 a Pettersson, B. M. Fredriku Uppsala universitet,Kemisk biologi4 aut0 (Swepub:uu)frpet227
7001 a Behra, Phani Rama Krishnau Uppsala universitet,Kemisk biologi4 aut0 (Swepub:uu)behph854
7001 a Ramesh, Malavikau Uppsala universitet,Kemisk biologi4 aut0 (Swepub:uu)malra274
7001 a Dasgupta, Santanuu Uppsala universitet,Mikrobiologi4 aut0 (Swepub:uu)sda03860
7001 a Bhattacharya, Aloku Jawaharlal Nehru Univ, Sch Computat & Integrat Sci, New Delhi 110067, India.;Jawaharlal Nehru Univ, Sch Life Sci, New Delhi 110067, India.4 aut
7001 a Kirsebom, Leif A.u Uppsala universitet,Kemisk biologi4 aut0 (Swepub:uu)leifkirs
7102 a Uppsala universitetb Kemisk biologi4 org
7730 t Genome Biology and Evolutiond : Oxford University Press (OUP)g 8:4, s. 975-985q 8:4<975-985x 1759-6653
8564 u https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:945450/FULLTEXT01.pdfx primaryx Raw objecty fulltext:print
8564 u https://academic.oup.com/gbe/article-pdf/8/4/975/17476303/evw049.pdf
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-298249
8564 8u https://doi.org/10.1093/gbe/evw049

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy