A catalog of the mouse gut metagenome

We established a catalog of the mouse gut metagenome comprising similar to 2.6 million nonredundant genes by sequencing DNA from fecal samples of 184 mice. To secure high microbiome diversity, we used mouse strains of diverse genetic backgrounds, from different providers, kept in different housing laboratories and fed either a low-fat or high-fat diet. Similar to the human gut microbiome, >99% of the cataloged genes are bacterial. We identified 541 metagenomic species and defined a core set of 26 metagenomic species found in 95% of the mice. The mouse gut microbiome is functionally similar to its human counterpart, with 95.2% of its Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) orthologous groups in common. However, only 4.0% of the mouse gut microbial genes were shared (95% identity, 90% coverage) with those of the human gut microbiome. This catalog provides a useful reference for future studies.

Feng, Q. (författare)
Liang, S. S. (författare)
Sonne, S. B. (författare)
Xia, Z. K. (författare)
Qiu, X. M. (författare)
Li, X. P. (författare)
Long, H. (författare)
Zhang, J. F. (författare)
Zhang, D. Y. (författare)
Liu, C. (författare)
Fang, Z. W. (författare)
Chou, J. (författare)
Glanville, J. (författare)
Hao, Q. (författare)
Kotowska, D. (författare)
Colding, C. (författare)
Licht, T. R. (författare)
Wu, D. H. (författare)
Yu, J. (författare)
Sung, J. J. Y. (författare)
Liang, Q. Y. (författare)
Li, J. H. (författare)
Jia, H. J. (författare)
Lan, Z. (författare)
Tremaroli, Valentina,1978Gothenburg University,Göteborgs universitet,Wallenberglaboratoriet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberg Laboratory,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine(Swepub:gu)xtreva (författare)
Dworzynski, P. (författare)
Nielsen, H. B. (författare)
Bäckhed, Fredrik,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberglaboratoriet,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Wallenberg Laboratory(Swepub:gu)xbafre (författare)
Dore, J. (författare)
Le Chatelier, E. (författare)
Ehrlich, S. D. (författare)
Lin, J. C. (författare)
Arumugam, M. (författare)
Wang, J. (författare)
Madsen, L. (författare)
Kristiansen, K. (författare)
Göteborgs universitetWallenberglaboratoriet (creator_code:org_t)

Ingår i:Nature Biotechnology: Springer Science and Business Media LLC33:101087-01561546-1696

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.