Fluorescence Bar-Coding and Flowmetry Based on Dark State Transitions in Fluorescence Emitters

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Sandberg Elin) > Fluorescence Bar-Co...

Sandberg, ElinKTH,Kvant- och biofotonik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden (författare)

Fluorescence Bar-Coding and Flowmetry Based on Dark State Transitions in Fluorescence Emitters

Artikel/kapitelEngelska2024

Förlag, utgivningsår, omfång ...

American Chemical Society (ACS),2024
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-342739
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-342739URI
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c06905DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

QC 20240206
Reversible dark state transitions in fluorophores represent a limiting factor in fluorescence-based ultrasensitive spectroscopy, are a necessary basis for fluorescence-based super-resolution imaging, but may also offer additional, largely orthogonal fluorescence-based readout parameters. In this work, we analyzed the blinking kinetics of Cyanine5 (Cy5) as a bar-coding feature distinguishing Cy5 from rhodamine fluorophores having largely overlapping emission spectra. First, fluorescence correlation spectroscopy (FCS) solution measurements on mixtures of free fluorophores and fluorophore-labeled small unilamellar vesicles (SUVs) showed that Cy5 could be readily distinguished from the rhodamines by its reversible, largely excitation-driven trans-cis isomerization. This was next confirmed by transient state (TRAST) spectroscopy measurements, determining the fluorophore dark state kinetics in a more robust manner, from how the time-averaged fluorescence intensity varies upon modulation of the applied excitation light. TRAST was then combined with wide-field imaging of live cells, whereby Cy5 and rhodamine fluorophores could be distinguished on a whole cell level as well as in spatially resolved, multiplexed images of the cells. Finally, we established a microfluidic TRAST concept and showed how different mixtures of free Cy5 and rhodamine fluorophores and corresponding fluorophore-labeled SUVs could be distinguished on-the-fly when passing through a microfluidic channel. In contrast to FCS, TRAST does not rely on single-molecule detection conditions or a high time resolution and is thus broadly applicable to different biological samples. Therefore, we expect that the bar-coding concept presented in this work can offer an additional useful strategy for fluorescence-based multiplexing that can be implemented on a broad range of both stationary and moving samples.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Biofysik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biophysics hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Demirbay, BarisKTH,Kvant- och biofotonik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden(Swepub:kth)u10bas52 (författare)
Kulkarni, AbhilashKTH,Tillämpad fysik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden(Swepub:kth)u1wrw20i (författare)
Liu, HaichunKTH,Kvant- och biofotonik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden(Swepub:kth)u1mn5cz0 (författare)
Piguet, Joachim,1979-KTH,Kvant- och biofotonik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden(Swepub:kth)u1s3pwbd (författare)
Widengren, JerkerKTH,Kvant- och biofotonik,Albanova University Center, 106 91 Stockholm, Sweden(Swepub:kth)u1i3g09c (författare)
KTHKvant- och biofotonik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Physical Chemistry B: American Chemical Society (ACS)128:1, s. 125-1361520-61061520-5207

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Journal of Physical Chemistry B (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Sandberg, Elin; Demirbay, Baris; Kulkarni, Abhila ...; Liu, Haichun; Piguet, Joachim, ...; Widengren, Jerke ...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biofysik

Artiklar i publikationen: Journal of Physi ...

Av lärosätet: Kungliga Tekniska Högskolan

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se