Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-531498" >
GBS-MeDIP :
GBS-MeDIP : A protocol for parallel identification of genetic and epigenetic variation in the same reduced fraction of genomes across individuals
-
- Rezaei, Shiva (författare)
- Linköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,University of Tabriz, Tabriz, Iran,Univ Tabriz, Fac Nat Sci, Dept Anim Biol, Tabriz 5166616471, Iran.;Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.
-
- Uffenorde, Julia (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för neurobiologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Kirurgiska kliniken US,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.
-
- Gimm, Oliver, 1967- (författare)
- Linköpings universitet,Avdelningen för kirurgi, ortopedi och onkologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Kirurgiska kliniken US,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.
-
visa fler...
-
- Feizi, Mohammad Ali Hosseinpour (författare)
- Univ Tabriz, Fac Nat Sci, Dept Anim Biol, Tabriz 5166616471, Iran.,University of Tabriz, Tabriz, Iran
-
- Miemczyk, Stefan (författare)
- Linköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.
-
- Lehman Coutinho, Luiz (författare)
- Uppsala universitet,Miljötoxikologi,Uppsala University, Sweden
-
- Jensen, Per, 1956- (författare)
- Linköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.
-
- Guerrero-Bosagna, Carlos, 1975- (författare)
- Linköpings universitet,Uppsala universitet,Miljötoxikologi,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.,Biologi,Tekniska fakulteten,Uppsala University, Sweden
-
- Pèrtille, Fábio (författare)
- Linköpings universitet,Uppsala universitet,Miljötoxikologi,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.;Univ Sao Paulo, Anim Sci Dept, Anim Biotechnol Lab, Luiz de Queiroz Coll Agr ESALQ, BR-1341890 Piracicaba, SP, Brazil.,Avdelningen för cellbiologi,Medicinska fakulteten,Biologi,Tekniska fakulteten,Uppsala University, Sweden; College of Agriculture (ESALQ), Brazil
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Cell Press, 2022
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: STAR protocols. - : Cell Press. - 2666-1667. ; 3:1
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://doi.org/10.1...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The GBS-MeDIP protocol combines two previously described techniques, Geno-type-by-Sequencing (GBS) and Methylated-DNA- Immunoprecipitation (MeDIP). Our method allows for parallel and cost-efficient interrogation of genetic and methylomic variants in the DNA of many reduced genomes, taking advantage of the barcoding of DNA samples performed in the GBS and the subsequent creation of DNA pools, then used as an input for the MeDIP. The GBS-MeDIP is particularly suitable to identify genetic and methylomic biomarkers when resources for whole genome interrogation are lacking.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- Cancer
- Clinical Protocol
- Genomics
- Sequencing
- High Throughput Screening
- Molecular Biology
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Rezaei, Shiva
-
Uffenorde, Julia
-
Gimm, Oliver, 19 ...
-
Feizi, Mohammad ...
-
Miemczyk, Stefan
-
Lehman Coutinho, ...
-
visa fler...
-
Jensen, Per, 195 ...
-
Guerrero-Bosagna ...
-
Pèrtille, Fábio
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
- Artiklar i publikationen
-
STAR protocols
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Linköpings universitet