SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ho GH)
 

Sökning: WFRF:(Ho GH) > Nuclear ribosomal i...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00009310naa a2202269 4500
001oai:gup.ub.gu.se/156845
003SwePub
008240528s2012 | |||||||||||000 ||eng|
024a https://gup.ub.gu.se/publication/1568452 URI
024a https://doi.org/10.1073/pnas.11170181092 DOI
040 a (SwePub)gu
041 a eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
100a Schoch, CL4 aut
2451 0a Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi
264 c 2012-03-27
264 1b Proceedings of the National Academy of Sciences,c 2012
520 a Six DNA regions were evaluated as potential DNA barcodes for Fungi, the second largest kingdom of eukaryotic life, by a multinational, multilaboratory consortium. The region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 used as the animal barcode was excluded as a potential marker, because it is difficult to amplify in fungi, often includes large introns, and can be insufficiently variable. Three subunits from the nuclear ribosomal RNA cistron were compared together with regions of three representative protein-coding genes (largest subunit of RNA polymerase II, second largest subunit of RNA polymerase II, and minichromosome maintenance protein). Although the protein-coding gene regions often had a higher percent of correct identification compared with ribosomal markers, low PCR amplification and sequencing success eliminated them as candidates for a universal fungal barcode. Among the regions of the ribosomal cistron, the internal transcribed spacer (ITS) region has the highest probability of successful identification for the broadest range of fungi, with the most clearly defined barcode gap between inter- and intraspecific variation. The nuclear ribosomal large subunit, a popular phylogenetic marker in certain groups, had superior species resolution in some taxonomic groups, such as the early diverging lineages and the ascomycete yeasts, but was otherwise slightly inferior to the ITS. The nuclear ribosomal small subunit has poor species-level resolution in fungi. ITS will be formally proposed for adoption as the primary fungal barcode marker to the Consortium for the Barcode of Life, with the possibility that supplementary barcodes may be developed for particular narrowly circumscribed taxonomic groups.
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaperx Mikrobiologi inom det medicinska området0 (SwePub)301092 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Basic Medicinex Microbiology in the medical area0 (SwePub)301092 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biologisk systematik0 (SwePub)106122 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biological Systematics0 (SwePub)106122 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Mikrobiologi0 (SwePub)106062 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Microbiology0 (SwePub)106062 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Bioinformatik och systembiologi0 (SwePub)106102 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Bioinformatics and Systems Biology0 (SwePub)106102 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Zoologi0 (SwePub)106082 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Zoology0 (SwePub)106082 hsv//eng
653 a Fungi ; barcoding ; ITS
700a Seifert, KA4 aut
700a Huhndorf, S4 aut
700a Robert, Vincent4 aut
700a Spouge, JL4 aut
700a Levesque, CA4 aut
700a Chen, W4 aut
700a Bolchacova, E4 aut
700a Voigt, K4 aut
700a Crous, PW4 aut
700a Miller, AN4 aut
700a Wingfield, MJ4 aut
700a Aime, MC4 aut
700a An, KD4 aut
700a Bai, FY4 aut
700a Barreto, RW4 aut
700a Begerow, D4 aut
700a Bergeron, MJ4 aut
700a Blackwell, M4 aut
700a Boekhout, T4 aut
700a Bogale, M4 aut
700a Boonyuen, N4 aut
700a Burgaz, AR4 aut
700a Buyck, B4 aut
700a Cai, L4 aut
700a Cai, Q4 aut
700a Cardinali, G4 aut
700a Chaverri, P4 aut
700a Coppins, BJ4 aut
700a Crespo, A4 aut
700a Cubas, P4 aut
700a Cummings, C4 aut
700a Damm, U4 aut
700a de Beer, ZW4 aut
700a de Hoog, GS4 aut
700a Del-Prado, R4 aut
700a Dentinger, B4 aut
700a Diéguez-Uribeondo, J4 aut
700a Divakar, PK4 aut
700a Douglas, B4 aut
700a Dueñas, M4 aut
700a Duong, TA4 aut
700a Eberhardt, U4 aut
700a Edwards, JE4 aut
700a Elshahed, MS4 aut
700a Fliegerova, K4 aut
700a Furtado, M4 aut
700a García, M4 aut
700a Ge, ZW4 aut
700a Griffith, GW4 aut
700a Griffiths, K4 aut
700a Groenewald, JZ4 aut
700a Groenewald, M4 aut
700a Grube, M4 aut
700a Gryzenhout, M4 aut
700a Guo, LD4 aut
700a Hagen, F4 aut
700a Hambleton, S4 aut
700a Hamelin, RC4 aut
700a Hansen, K4 aut
700a Harrold, P4 aut
700a Heller, G4 aut
700a Herrera, C4 aut
700a Hirayama, K4 aut
700a Hirooka, Y4 aut
700a Ho, HM4 aut
700a Hoffmann, K4 aut
700a Hofstetter, V4 aut
700a Högnabba, F4 aut
700a Hollingsworth, PM4 aut
700a Hong, SB4 aut
700a Hosaka, K4 aut
700a Houbraken, J4 aut
700a Hughes, K4 aut
700a Huhtinen, S4 aut
700a Hyde, KD4 aut
700a James, T4 aut
700a Johnson, EM4 aut
700a Johnson, JE4 aut
700a Johnston, PR4 aut
700a Jones, EB4 aut
700a Kelly, LJ4 aut
700a Kirk, PM4 aut
700a Knapp, DG4 aut
700a Kõljalg, U4 aut
700a Kovács, GM4 aut
700a Kurtzman, CP4 aut
700a Landvik, S4 aut
700a Leavitt, SD4 aut
700a Liggenstoffer, AS4 aut
700a Liimatainen, K4 aut
700a Lombard, L4 aut
700a Luangsa-Ard, JJ4 aut
700a Lumbsch, HT4 aut
700a Maganti, H4 aut
700a Maharachchikumbura, SS4 aut
700a Martin, MP4 aut
700a May, TW4 aut
700a McTaggart, AR4 aut
700a Methven, AS4 aut
700a Meyer, W4 aut
700a Moncalvo, J-M4 aut
700a Mongkolsamrit, S4 aut
700a Nagy, LG4 aut
700a Nilsson, R. Henrik,d 1976u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences4 aut0 (Swepub:gu)xnihen
700a Niskanen, T4 aut
700a Nyilasi, I4 aut
700a Okada, G4 aut
700a Okane, I4 aut
700a Olariaga, I4 aut
700a Otte, J4 aut
700a Papp, T4 aut
700a Park, D4 aut
700a Petkovits, T4 aut
700a Pino-Bodas, R4 aut
700a Quaedvlieg, W4 aut
700a Raja, HA4 aut
700a Redecker, D4 aut
700a Rintoul, TL4 aut
700a Ruibal, C4 aut
700a Sarmiento-Ramírez, JM4 aut
700a Schmitt, I4 aut
700a Schüßler, A4 aut
700a Shearer, C4 aut
700a Sotome, K4 aut
700a Stefani, FO4 aut
700a Stenroos, S4 aut
700a Stielow, B4 aut
700a Stockinger, H4 aut
700a Suetrong, S4 aut
700a Suh, SO4 aut
700a Sung, GH4 aut
700a Suzuki, M4 aut
700a Tanaka, K4 aut
700a Tedersoo, L4 aut
700a Telleria, MT4 aut
700a Tretter, E4 aut
700a Untereiner, WA4 aut
700a Urbina, H4 aut
700a Vágvölgyi, C4 aut
700a Vialle, A4 aut
700a Vu, TD4 aut
700a Walther, G4 aut
700a Wang, QM4 aut
700a Wang, Y4 aut
700a Weir, BS4 aut
700a Weiß, M4 aut
700a White, MM4 aut
700a Xu, J4 aut
700a Yahr, R4 aut
700a Yang, ZL4 aut
700a Yurkov, A4 aut
700a Zamora, JC4 aut
700a Zhang, N4 aut
700a Zhuang, WY4 aut
700a Schindel, D4 aut
710a Göteborgs universitetb Institutionen för biologi och miljövetenskap4 org
773t Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Americad : Proceedings of the National Academy of Sciencesg 109:16, s. 6241-6246q 109:16<6241-6246x 1091-6490
773t Proceedings of the National Academy of Sciencesd : Proceedings of the National Academy of Sciencesg 109:16, s. 6241-6246q 109:16<6241-6246x 0027-8424
856u https://www.pnas.org/content/pnas/109/16/6241.full.pdf
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/156845
8564 8u https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Schoch, CL
Seifert, KA
Huhndorf, S
Robert, Vincent
Spouge, JL
Levesque, CA
visa fler...
Chen, W
Bolchacova, E
Voigt, K
Crous, PW
Miller, AN
Wingfield, MJ
Aime, MC
An, KD
Bai, FY
Barreto, RW
Begerow, D
Bergeron, MJ
Blackwell, M
Boekhout, T
Bogale, M
Boonyuen, N
Burgaz, AR
Buyck, B
Cai, L
Cai, Q
Cardinali, G
Chaverri, P
Coppins, BJ
Crespo, A
Cubas, P
Cummings, C
Damm, U
de Beer, ZW
de Hoog, GS
Del-Prado, R
Dentinger, B
Diéguez-Uribeond ...
Divakar, PK
Douglas, B
Dueñas, M
Duong, TA
Eberhardt, U
Edwards, JE
Elshahed, MS
Fliegerova, K
Furtado, M
García, M
Ge, ZW
Griffith, GW
Griffiths, K
Groenewald, JZ
Groenewald, M
Grube, M
Gryzenhout, M
Guo, LD
Hagen, F
Hambleton, S
Hamelin, RC
Hansen, K
Harrold, P
Heller, G
Herrera, C
Hirayama, K
Hirooka, Y
Ho, HM
Hoffmann, K
Hofstetter, V
Högnabba, F
Hollingsworth, P ...
Hong, SB
Hosaka, K
Houbraken, J
Hughes, K
Huhtinen, S
Hyde, KD
James, T
Johnson, EM
Johnson, JE
Johnston, PR
Jones, EB
Kelly, LJ
Kirk, PM
Knapp, DG
Kõljalg, U
Kovács, GM
Kurtzman, CP
Landvik, S
Leavitt, SD
Liggenstoffer, A ...
Liimatainen, K
Lombard, L
Luangsa-Ard, JJ
Lumbsch, HT
Maganti, H
Maharachchikumbu ...
Martin, MP
May, TW
McTaggart, AR
Methven, AS
Meyer, W
Moncalvo, J-M
Mongkolsamrit, S
Nagy, LG
Nilsson, R. Henr ...
Niskanen, T
Nyilasi, I
Okada, G
Okane, I
Olariaga, I
Otte, J
Papp, T
Park, D
Petkovits, T
Pino-Bodas, R
Quaedvlieg, W
Raja, HA
Redecker, D
Rintoul, TL
Ruibal, C
Sarmiento-Ramíre ...
Schmitt, I
Schüßler, A
Shearer, C
Sotome, K
Stefani, FO
Stenroos, S
Stielow, B
Stockinger, H
Suetrong, S
Suh, SO
Sung, GH
Suzuki, M
Tanaka, K
Tedersoo, L
Telleria, MT
Tretter, E
Untereiner, WA
Urbina, H
Vágvölgyi, C
Vialle, A
Vu, TD
Walther, G
Wang, QM
Wang, Y
Weir, BS
Weiß, M
White, MM
Xu, J
Yahr, R
Yang, ZL
Yurkov, A
Zamora, JC
Zhang, N
Zhuang, WY
Schindel, D
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska och f ...
och Mikrobiologi ino ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Biologisk system ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Mikrobiologi
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Bioinformatik oc ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Zoologi
Artiklar i publikationen
Proceedings of t ...
Proceedings of t ...
Av lärosätet
Göteborgs universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy