SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Stacey Martin)
 

Sökning: WFRF:(Stacey Martin) > Distribution and Me...

  • Lim, Elaine T (författare)

Distribution and Medical Impact of Loss-of-Function Variants in the Finnish Founder Population.

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2014-07-31
  • Public Library of Science (PLoS),2014

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:8743af47-dbae-4236-8657-348ec9a939d3
  • https://lup.lub.lu.se/record/4615846URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004494DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Exome sequencing studies in complex diseases are challenged by the allelic heterogeneity, large number and modest effect sizes of associated variants on disease risk and the presence of large numbers of neutral variants, even in phenotypically relevant genes. Isolated populations with recent bottlenecks offer advantages for studying rare variants in complex diseases as they have deleterious variants that are present at higher frequencies as well as a substantial reduction in rare neutral variation. To explore the potential of the Finnish founder population for studying low-frequency (0.5-5%) variants in complex diseases, we compared exome sequence data on 3,000 Finns to the same number of non-Finnish Europeans and discovered that, despite having fewer variable sites overall, the average Finn has more low-frequency loss-of-function variants and complete gene knockouts. We then used several well-characterized Finnish population cohorts to study the phenotypic effects of 83 enriched loss-of-function variants across 60 phenotypes in 36,262 Finns. Using a deep set of quantitative traits collected on these cohorts, we show 5 associations (p<5×10-8) including splice variants in LPA that lowered plasma lipoprotein(a) levels (P = 1.5×10-117). Through accessing the national medical records of these participants, we evaluate the LPA finding via Mendelian randomization and confirm that these splice variants confer protection from cardiovascular disease (OR = 0.84, P = 3×10-4), demonstrating for the first time the correlation between very low levels of LPA in humans with potential therapeutic implications for cardiovascular diseases. More generally, this study articulates substantial advantages for studying the role of rare variation in complex phenotypes in founder populations like the Finns and by combining a unique population genetic history with data from large population cohorts and centralized research access to National Health Registers.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Würtz, Peter (författare)
  • Havulinna, Aki S (författare)
  • Palta, Priit (författare)
  • Tukiainen, Taru (författare)
  • Rehnström, Karola (författare)
  • Esko, Tõnu (författare)
  • Mägi, Reedik (författare)
  • Inouye, Michael (författare)
  • Lappalainen, Tuuli (författare)
  • Chan, Yingleong (författare)
  • Salem, Rany M (författare)
  • Lek, Monkol (författare)
  • Flannick, Jason (författare)
  • Sim, Xueling (författare)
  • Manning, Alisa (författare)
  • Ladenvall, ClaesLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-cll (författare)
  • Bumpstead, Suzannah (författare)
  • Hämäläinen, Eija (författare)
  • Aalto, Kristiina (författare)
  • Maksimow, Mikael (författare)
  • Salmi, Marko (författare)
  • Blankenberg, Stefan (författare)
  • Ardissino, Diego (författare)
  • Shah, Svati (författare)
  • Horne, Benjamin (författare)
  • McPherson, Ruth (författare)
  • Hovingh, Gerald K (författare)
  • Reilly, Muredach P (författare)
  • Watkins, Hugh (författare)
  • Goel, Anuj (författare)
  • Farrall, Martin (författare)
  • Girelli, Domenico (författare)
  • Reiner, Alex P (författare)
  • Stitziel, Nathan O (författare)
  • Kathiresan, Sekar (författare)
  • Gabriel, Stacey (författare)
  • Barrett, Jeffrey C (författare)
  • Lehtimäki, Terho (författare)
  • Laakso, Markku (författare)
  • Groop, LeifLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-lgr (författare)
  • Kaprio, Jaakko (författare)
  • Perola, MarkusLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-mkp (författare)
  • McCarthy, Mark I (författare)
  • Boehnke, Michael (författare)
  • Altshuler, David M (författare)
  • Lindgren, Cecilia ALund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-clr (författare)
  • Hirschhorn, Joel N (författare)
  • Metspalu, Andres (författare)
  • Freimer, Nelson B (författare)
  • Zeller, Tanja (författare)
  • Jalkanen, Sirpa (författare)
  • Koskinen, Seppo (författare)
  • Raitakari, Olli (författare)
  • Durbin, Richard (författare)
  • MacArthur, Daniel G (författare)
  • Salomaa, Veikko (författare)
  • Ripatti, SamuliLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-sur (författare)
  • Daly, MarkLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-mkd (författare)
  • Palotie, AarnoLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-aop (författare)
  • Genomik, diabetes och endokrinologiForskargrupper vid Lunds universitet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)10:71553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy