SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Günther Torsten)
 

Sökning: WFRF:(Günther Torsten) > Robust genome-wide ...

  • Li, JiaruiUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Elect Engn, ESAT PSI, Leuven, Belgium. (författare)

Robust genome-wide ancestry inference for heterogeneous datasets : illustrated using the 1,000 genome project with 3D facial images

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-07-16
  • Springer Science and Business Media LLC,2020
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-419786
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-419786URI
  • https://doi.org/10.1038/s41598-020-68259-wDOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Estimates of individual-level genomic ancestry are routinely used in human genetics, and related fields. The analysis of population structure and genomic ancestry can yield insights in terms of modern and ancient populations, allowing us to address questions regarding admixture, and the numbers and identities of the parental source populations. Unrecognized population structure is also an important confounder to correct for in genome-wide association studies. However, it remains challenging to work with heterogeneous datasets from multiple studies collected by different laboratories with diverse genotyping and imputation protocols. This work presents a new approach and an accompanying open-source toolbox that facilitates a robust integrative analysis for population structure and genomic ancestry estimates for heterogeneous datasets. We show robustness against individual outliers and different protocols for the projection of new samples into a reference ancestry space, and the ability to reveal and adjust for population structure in a simulated case-control admixed population. Given that visually evident and easily recognizable patterns of human facial characteristics co-vary with genomic ancestry, and based on the integration of three different sources of genome data, we generate average 3D faces to illustrate genomic ancestry variations within the 1,000 Genome project and for eight ancient-DNA profiles, respectively.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Zarzar, Tomas GonzalezPenn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA. (författare)
  • White, Julie D.Penn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA. (författare)
  • Indencleef, KarlijneUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Neurosci, Expt Otorhinolaryngol, Leuven, Belgium. (författare)
  • Hoskens, HanneUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Human Genet, Leuven, Belgium. (författare)
  • Matthews, HarryUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Human Genet, Leuven, Belgium.;Murdoch Childrens Res Inst, Melbourne, Vic, Australia. (författare)
  • Nauwelaers, NeleUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Elect Engn, ESAT PSI, Leuven, Belgium. (författare)
  • Zaidi, ArslanPenn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA. (författare)
  • Eller, Ryan J.Indiana Univ Purdue Univ Indianapolis, Dept Biol, Indianapolis, IN USA. (författare)
  • Herrick, NoahIndiana Univ Purdue Univ Indianapolis, Dept Biol, Indianapolis, IN USA. (författare)
  • Günther, TorstenUppsala universitet,Människans evolution(Swepub:uu)torgu835 (författare)
  • Svensson, Emma,1979-Uppsala universitet,Människans evolution(Swepub:uu)emsve020 (författare)
  • Jakobsson, MattiasUppsala universitet,Människans evolution(Swepub:uu)matja323 (författare)
  • Walsh, SusanIndiana Univ Purdue Univ Indianapolis, Dept Biol, Indianapolis, IN USA. (författare)
  • Van Steen, KristelKatholieke Univ Leuven, Dept Human Genet, Leuven, Belgium.;Univ Liege, Med Genom Res Unit, GIGA R, Liege, Belgium.;Walloon Excellence Life Sci & Biotechnol WELBIO, Liege, Belgium. (författare)
  • Shriver, Mark D.Penn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA. (författare)
  • Claes, PeterUniv Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Elect Engn, ESAT PSI, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Human Genet, Leuven, Belgium.;Murdoch Childrens Res Inst, Melbourne, Vic, Australia. (författare)
  • Univ Hosp Leuven, MIRC, Med Imaging Res Ctr, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Dept Elect Engn, ESAT PSI, Leuven, Belgium.Penn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Scientific Reports: Springer Science and Business Media LLC10:12045-2322

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy