Sökning: WFRF:(Becher J) >
Novel cancer gene d...
Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
-
- Weishaupt, Holger (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Čančer, Matko (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Rosén, Gabriela (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa fler...
-
- Holmberg, Karl O. (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Häggqvist, Susana (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Bunikis, Ignas (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Jiang, Yiwen (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Sreedharan, Smitha, 1981- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Gyllensten, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genomik och neurobiologi,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Becher, Oren J. (författare)
- Northwestern Univ, Dept Pediat, Chicago, IL 60611 USA.;Northwestern Univ, Dept Biochem & Mol Genet, Chicago, IL 60611 USA.;Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Pediat, New York, NY 10029 USA.;Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Oncol Sci, New York, NY 10029 USA.
-
- Uhrbom, Lene (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Ameur, Adam (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala universitet, Institutionen för immunologi, genetik och patologi
-
- Swartling, Fredrik J., 1975- (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi och neurodegeneration,Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-06-23
- 2023
- Engelska.
-
Ingår i: Neuro-Oncology. - : Oxford University Press. - 1522-8517 .- 1523-5866. ; 25:1, s. 97-107
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Background Malignant gliomas, the most common malignant brain tumors in adults, represent a heterogeneous group of diseases with poor prognosis. Retroviruses can cause permanent genetic alterations that modify genes close to the viral integration site. Methods Here we describe the use of a high-throughput pipeline coupled to the commonly used tissue-specific retroviral RCAS-TVA mouse tumor model system. Utilizing next-generation sequencing, we show that retroviral integration sites can be reproducibly detected in malignant stem cell lines generated from RCAS-PDGFB-driven glioma biopsies. Results A large fraction of common integration sites contained genes that have been dysregulated or misexpressed in glioma. Others overlapped with loci identified in previous glioma-related forward genetic screens, but several novel putative cancer-causing genes were also found. Integrating retroviral tagging and clinical data, Ppfibp1 was highlighted as a frequently tagged novel glioma-causing gene. Retroviral integrations into the locus resulted in Ppfibp1 upregulation, and Ppfibp1-tagged cells generated tumors with shorter latency on orthotopic transplantation. In human gliomas, increased PPFIBP1 expression was significantly linked to poor prognosis and PDGF treatment resistance. Conclusions Altogether, the current study has demonstrated a novel approach to tagging glioma genes via forward genetics, validating previous results, and identifying PPFIBP1 as a putative oncogene in gliomagenesis.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- forward genetics screen
- glioblastoma
- liprin-beta-1
- PDGFB
- RCAS
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Weishaupt, Holge ...
-
Čančer, Matko
-
Rosén, Gabriela
-
Holmberg, Karl O ...
-
Häggqvist, Susan ...
-
Bunikis, Ignas
-
visa fler...
-
Jiang, Yiwen
-
Sreedharan, Smit ...
-
Gyllensten, Ulf
-
Becher, Oren J.
-
Uhrbom, Lene
-
Ameur, Adam
-
Swartling, Fredr ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Neuro-Oncology
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Gymnastik- och idrottshögskolan