SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lindh Anders)
 

Sökning: WFRF:(Lindh Anders) > A comprehensive dat...

  • Latz, MeikeKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi,University of Copenhagen, Department of Plant and Environmental Sciences, Frederiksberg C, Denmark (författare)

A comprehensive dataset on spatiotemporal variation of microbial plankton communities in the Baltic Sea

  • Artikel/kapitelEngelska2024

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Springer Nature,2024
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-219321
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-219321URI
  • https://doi.org/10.1038/s41597-023-02825-5DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-342167URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The raw sequencing data generated in this study are available at the European Nucleotide Archive (ENA) under the study accession number https://identifiers.org/ena.embl:PRJEB55296 (2023).Processed sequencing data (ASV sequences with taxonomic annotations and counts in samples) are available at our figshare repository (https://doi.org/10.17044/scilifelab.20751373), along with the contextual, physicochemical, and microscopy data, and sequences of synthetic spike-ins. 
  • QC 20240115
  • The Baltic Sea is one of the largest brackish water environments on earth and is characterised by pronounced physicochemical gradients and seasonal dynamics. Although the Baltic Sea has a long history of microscopy-based plankton monitoring, DNA-based metabarcoding has so far mainly been limited to individual transect cruises or time-series of single stations. Here we report a dataset covering spatiotemporal variation in prokaryotic and eukaryotic microbial communities and physicochemical parameters. Within 13-months between January 2019 and February 2020, 341 water samples were collected at 22 stations during monthly cruises along the salinity gradient. Both salinity and seasonality are strongly reflected in the data. Since the dataset was generated with both metabarcoding and microscopy-based methods, it provides unique opportunities for both technical and ecological analyses, and is a valuable biodiversity reference for future studies, in the prospect of climate change.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Andersson, AgnetaUmeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Umeå marina forskningscentrum (UMF),EcoChange; UMFpub,Umeå University, Department of Ecology and Environmental Sciences, Umeå, Sweden; Umeå Marine Sciences Centre, Umeå University, SE-905 71, Hörnefors, Sweden(Swepub:umu)agan0002 (författare)
  • Brugel, SoniaUmeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Umeå marina forskningscentrum (UMF),Umeå University, Department of Ecology and Environmental Sciences, Umeå, Sweden; Umeå Marine Sciences Centre, Umeå University, SE-905 71, Hörnefors, Sweden(Swepub:umu)sobr0017 (författare)
  • Hedblom, MikaelSwedish Meteorological and Hydrological Institute, Community Planning Services - Oceanography, Västra Frölunda, Sweden (författare)
  • Jurdzinski, Krzysztof T.KTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1ensv7u (författare)
  • Karlson, BengtSwedish Meteorological and Hydrological Institute, Oceanographic Research, Västra Frölunda, Sweden (författare)
  • Lindh, MarkusSwedish Meteorological and Hydrological Institute, Community Planning Services - Oceanography, Västra Frölunda, Sweden (författare)
  • Lycken, JennySwedish Meteorological and Hydrological Institute, Community Planning Services - Oceanography, Västra Frölunda, Sweden (författare)
  • Torstensson, AndersSwedish Meteorological and Hydrological Institute, Community Planning Services - Oceanography, Västra Frölunda, Sweden (författare)
  • Andersson, Anders F.KTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Genteknologi(Swepub:kth)u1hi776x (författare)
  • KTHScience for Life Laboratory, SciLifeLab (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Scientific Data: Springer Nature11:12052-4463

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy