SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Larsson Mårten)
 

Sökning: WFRF:(Larsson Mårten) > Label free quantifi...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00004080naa a2200445 4500
001oai:DiVA.org:uu-234563
003SwePub
008141021s2015 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-2345632 URI
0247 a https://doi.org/10.1103/PhysRevC.91.0246022 DOI
040 a (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Aftab, Obaid,d 1984-u Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)obaaf447
2451 0a Label free quantification of time evolving morphologies using time-lapse video microscopy enables identity control of cell lines and discovery of chemically induced differential activity in iso-genic cell line pairs
264 1c 2015
338 a print2 rdacarrier
520 a Label free time-lapse video microscopy based monitoring of time evolving cell population morphology has potential to offer a simple and cost effective method for identity control of cell lines. Such morphology monitoring also has potential to offer discovery of chemically induced differential changes between pairs of cell lines of interest, for example where one in a pair of cell lines is normal/sensitive and the other malignant/resistant. A new simple algorithm, pixel histogram hierarchy comparison (PHHC), for comparison of time evolving morphologies (TEM) in phase contrast time-lapse microscopy movies was applied to a set of 10 different cell lines and three different iso-genic colon cancer cell line pairs, each pair being genetically identical except for a single mutation. PHHC quantifies differences in morphology by comparing pixel histogram intensities at six different resolutions. Unsupervised clustering and machine learning based classification methods were found to accurately identify cell lines, including their respective iso-genic variants, through time-evolving morphology. Using this experimental setting, drugs with differential activity in iso-genic cell line pairs were likewise identified. Thus, this is a cost effective and expedient alternative to conventional molecular profiling techniques and might be useful as part of the quality control in research incorporating cell line models, e.g. in any cell/tumor biology or toxicology project involving drug/agent differential activity in pairs of cell line models.
650 7a NATURVETENSKAPx Data- och informationsvetenskapx Datavetenskap0 (SwePub)102012 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Computer and Information Sciencesx Computer Sciences0 (SwePub)102012 hsv//eng
650 7a MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAPx Klinisk medicinx Cancer och onkologi0 (SwePub)302032 hsv//swe
650 7a MEDICAL AND HEALTH SCIENCESx Clinical Medicinex Cancer and Oncology0 (SwePub)302032 hsv//eng
653 a Time evolving morphology
653 a quality control
653 a iso-genic cell line
653 a cancer pharmacology
653 a time-lapse microsopcy
653 a video microscopy
7001 a Fryknäs, Mårtenu Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)mafry516
7001 a Hassan, Saadiau Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)sadihass
7001 a Nygren, Peteru Uppsala universitet,Enheten för onkologi4 aut0 (Swepub:uu)peterng
7001 a Larsson, Rolfu Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)rolflars
7001 a Hammerling, Ulfu Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)ulfha787
7001 a Gustafsson, Matsu Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 aut0 (Swepub:uu)matsgust
7102 a Uppsala universitetb Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin4 org
7730 t Chemometrics and Intelligent Laboratory Systemsg 141, s. 24-32q 141<24-32x 0169-7439x 1873-3239
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-234563
8564 8u https://doi.org/10.1103/PhysRevC.91.024602

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy