SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Schallmeiner Edith)
 

Sökning: WFRF:(Schallmeiner Edith) > In vitro analysis o...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003400naa a2200481 4500
001oai:DiVA.org:uu-16648
003SwePub
008080602s2007 | |||||||||||000 ||eng|
0247 a https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-166482 URI
0247 a https://doi.org/10.1073/pnas.06112291042 DOI
040 a (SwePub)uu
041 a engb eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
1001 a Gustafsdottir, Sigrun M.u Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut
2451 0a In vitro analysis of DNA-protein interactions by proximity ligation
264 c 2007-02-27
264 1b Proceedings of the National Academy of Sciences,c 2007
338 a print2 rdacarrier
520 a Protein-binding DNA sequence elements encode a variety of regulated functions of genomes. Information about such elements is currently in a state of rapid growth, but improved methods are required to characterize the sequence specificity of DNA-binding proteins. We have established an in vitro method for specific and sensitive solution-phase analysis of interactions between proteins and nucleic acids in nuclear extracts, based on the proximity ligation assay. The reagent consumption is very low, and the excellent sensitivity of the assay enables analysis of as few as 1-10 cells. We show that our results are highly reproducible, quantitative, and in good agreement with both EMSA and predictions obtained by using a motif finding software. This assay can be a valuable tool to characterize in-depth the sequence specificity of DNA-binding proteins and to evaluate effects of polymorphisms in known transcription factor binding sites.
653 a DNA/*metabolism
653 a DNA-Binding Proteins/*metabolism
653 a Electrophoretic Mobility Shift Assay
653 a Genetic Techniques
653 a Models; Molecular
653 a Molecular Probes/genetics/metabolism
653 a Oligonucleotides/genetics/metabolism
653 a Polymerase Chain Reaction
653 a MEDICINE
653 a MEDICIN
7001 a Schlingemann, Jörgu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut
7001 a Rada-Iglesias, Alvarou Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut
7001 a Schallmeiner, Edithu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)edsch087
7001 a Kamali-Moghaddam, Masoodu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)masookam
7001 a Wadelius, Claesu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)claeswad
7001 a Landegren, Ulfu Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi4 aut0 (Swepub:uu)ulfland
7102 a Uppsala universitetb Institutionen för genetik och patologi4 org
7730 t Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Americad : Proceedings of the National Academy of Sciencesg 104:9, s. 3067-3072q 104:9<3067-3072x 0027-8424x 1091-6490
8564 u http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Retrieve&list_uids=17360610&dopt=Citation
8564 u http://www.pnas.org/content/104/9/3067.full.pdf
8564 8u https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-16648
8564 8u https://doi.org/10.1073/pnas.0611229104

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy