SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Poldmaa Kadri)
 

Sökning: WFRF:(Poldmaa Kadri) > Host genetic variat...

  • Pent, MariUniv Tartu, Inst Ecol & Earth Sci, Tartu, Estonia (författare)

Host genetic variation strongly influences the microbiome structure and function in fungal fruiting-bodies

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018-03-25
  • WILEY,2018
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-365992
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-365992URI
  • https://doi.org/10.1111/1462-2920.14069DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Despite increasing knowledge on host-associated microbiomes, little is known about mechanisms underlying fungus-microbiome interactions. This study aimed to examine the relative importance of host genetic, geographic and environmental variations in structuring fungus-associated microbiomes. We analyzed the taxonomic composition and function of microbiomes inhabiting fungal fruiting-bodies in relation to host genetic variation, soil pH and geographic distance between samples. For this, we sequenced the metagenomes of 40 fruiting-bodies collected from six fairy rings (i.e., genets) of a sapro-trophic fungus Marasmius oreades. Our analyses revealed that fine genetic variations between host fungi could strongly affect their associated microbiome, explaining, respectively, 25% and 37% of the variation in microbiome structure and function, whereas geographic distance and soil pH remained of secondary importance. These results, together with the smaller genome size of fungi compared to other eukaryotes, suggest that fruiting-bodies are suitable for further genome-centric studies on hostmicrobiome interactions.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Hiltunen, MarkusUppsala universitet,Systematisk biologi(Swepub:uu)marhi686 (författare)
  • Poldmaa, KadriUniv Tartu, Inst Ecol & Earth Sci, Tartu, Estonia (författare)
  • Furneaux, Brendan R.Uppsala universitet,Systematisk biologi(Swepub:uu)brefu599 (författare)
  • Hildebrand, FalkEuropean Mol Biol Lab, Struct & Computat Biol, Heidelberg, Germany (författare)
  • Johannesson, HannaUppsala universitet,Systematisk biologi(Swepub:uu)hajoh452 (författare)
  • Ryberg, MartinUppsala universitet,Systematisk biologi(Swepub:uu)marry118 (författare)
  • Bahram, MohammadUppsala universitet,Systematisk biologi,Univ Tartu, Inst Ecol & Earth Sci, Tartu, Estonia(Swepub:uu)mohba915 (författare)
  • Univ Tartu, Inst Ecol & Earth Sci, Tartu, EstoniaSystematisk biologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Environmental Microbiology: WILEY20:5, s. 1641-16501462-29121462-2920

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy