Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-119535" >
Assisted assembly :
-
Gnerre, Sante
(författare)
Assisted assembly : how to improve a de novo genome assembly by using related species
- Artikel/kapitelEngelska2009
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Springer Science and Business Media LLC,2009
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-119535
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-119535URI
-
https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-8-r88DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
We describe a new assembly algorithm, where a genome assembly with low sequence coverage, either throughout the genome or locally, due to cloning bias, is considerably improved through an assisting process via a related genome. We show that the information provided by aligning the whole-genome shotgun reads of the target against a reference genome can be used to substantially improve the quality of the resulting assembly.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Lander, Eric S
(författare)
-
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)kerli865
(författare)
-
Jaffe, David B
(författare)
-
Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Genome Biology: Springer Science and Business Media LLC10:8, s. R88-1465-69061474-760X
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas