SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:openarchive.ki.se:10616/47516"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:openarchive.ki.se:10616/47516" > Integration of gene...

  • Merid, Simon KebedeKarolinska Institutet (författare)

Integration of gene expression and DNA methylation identifies epigenetically controlled modules related to PM2.5 exposure

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Stockholm :Karolinska Institutet, Dept of Clinical Science and Education, Södersjukhuset,2020
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:openarchive.ki.se:10616/47516
  • ISSN:0160-4120
  • 10616/47516hdl
  • http://hdl.handle.net/10616/47516URI
  • https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.106248DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:145499116URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Air pollution has been associated with adverse health effects across the life-course. Although underlying mechanisms are unclear, several studies suggested pollutant-induced changes in transcriptomic profiles. In this meta-analysis of transcriptome-wide association studies of 656 children and adolescents from three European cohorts participating in the MeDALL Consortium, we found two differentially expressed transcript clusters (FDR p < 0.05) associated with exposure to particulate matter < 2.5 µm in diameter (PM2.5) at birth, one of them mapping to the MIR1296 gene. Further, by integrating gene expression with DNA methylation using Functional Epigenetic Modules algorithms, we identified 9 and 6 modules in relation to PM2.5 exposure at birth and at current address, respectively (including NR1I2, MAPK6, TAF8 and SCARA3). In conclusion, PM2.5 exposure at birth was linked to differential gene expression in children and adolescents. Importantly, we identified several significant interactome hotspots of gene modules of relevance for complex diseases in relation to PM2.5 exposure.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Bustamante, Mariona (författare)
  • Standl, Marie (författare)
  • Sunyer, Jordi (författare)
  • Heinrich, Joachim (författare)
  • Lemonnier, Nathanaël (författare)
  • Aguilar, Daniel (författare)
  • Antó, Josep Maria (författare)
  • Bousquet, Jean (författare)
  • Santa-Marina, Loreto (författare)
  • Lertxundi, Aitana (författare)
  • Bergström, AnnaKarolinska Institutet (författare)
  • Kull, IngerKarolinska Institutet (författare)
  • Wheelock, Åsa MKarolinska Institutet (författare)
  • Koppelman, Gerard H (författare)
  • Melén, ErikKarolinska Institutet (författare)
  • Gruzieva, OlenaKarolinska Institutet (författare)
  • Karolinska Institutet
  • Karolinska Institutet
  • Karolinska Institutet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Environment InternationalStockholm : Karolinska Institutet, Dept of Clinical Science and Education, Södersjukhuset0160-41201873-6750

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy