Atlas of prostate cancer heritability in European and African-American men pinpoints tissue-specific regulation

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:133315652" > Atlas of prostate c...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Gusev, A (författare)

Atlas of prostate cancer heritability in European and African-American men pinpoints tissue-specific regulation

Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016-04-07
Springer Science and Business Media LLC,2016

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:133315652
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:133315652URI
https://doi.org/10.1038/ncomms10979DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-122103URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Although genome-wide association studies have identified over 100 risk loci that explain ∼33% of familial risk for prostate cancer (PrCa), their functional effects on risk remain largely unknown. Here we use genotype data from 59,089 men of European and African American ancestries combined with cell-type-specific epigenetic data to build a genomic atlas of single-nucleotide polymorphism (SNP) heritability in PrCa. We find significant differences in heritability between variants in prostate-relevant epigenetic marks defined in normal versus tumour tissue as well as between tissue and cell lines. The majority of SNP heritability lies in regions marked by H3k27 acetylation in prostate adenoc7arcinoma cell line (LNCaP) or by DNaseI hypersensitive sites in cancer cell lines. We find a high degree of similarity between European and African American ancestries suggesting a similar genetic architecture from common variation underlying PrCa risk. Our findings showcase the power of integrating functional annotation with genetic data to understand the genetic basis of PrCa.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Shi, H (författare)
Kichaev, G (författare)
Pomerantz, M (författare)
Li, F (författare)
Long, HW (författare)
Ingles, SA (författare)
Kittles, RA (författare)
Strom, SS (författare)
Rybicki, BA (författare)
Nemesure, B (författare)
Isaacs, WB (författare)
Zheng, W (författare)
Pettaway, CA (författare)
Yeboah, ED (författare)
Tettey, Y (författare)
Biritwum, RB (författare)
Adjei, AA (författare)
Tay, E (författare)
Truelove, A (författare)
Niwa, S (författare)
Chokkalingam, AP (författare)
John, EM (författare)
Murphy, ABKarolinska Institutet (författare)
Signorello, LB (författare)
Carpten, J (författare)
Leske, MC (författare)
Wu, SY (författare)
Johansson, MattiasUmeå universitet,Enheten för biobanksforskning,Urologi och andrologi(Swepub:umu)masmas97 (författare)
Neslund-Dudas, C (författare)
Hsing, AW (författare)
Chu, L (författare)
Goodman, PJ (författare)
Klein, EA (författare)
Witte, JS (författare)
Casey, G (författare)
Kaggwa, S (författare)
Cook, MB (författare)
Stram, DO (författare)
Blot, WJ (författare)
Eeles, RA (författare)
Easton, D (författare)
Kote-Jarai, Z (författare)
Al Olama, AA (författare)
Benlloch, S (författare)
Muir, K (författare)
Giles, GG (författare)
Southey, MC (författare)
Fitzgerald, LM (författare)
Gronberg, HKarolinska Institutet (författare)
Wiklund, FKarolinska Institutet (författare)
Aly, MKarolinska Institutet (författare)
Henderson, BE (författare)
Schleutker, J (författare)
Wahlfors, T (författare)
Tammela, TLJ (författare)
Nordestgaard, BG (författare)
Key, TJ (författare)
Travis, RC (författare)
Neal, DE (författare)
Donovan, JL (författare)
Hamdy, FC (författare)
Pharoah, P (författare)
Pashayan, N (författare)
Khaw, KT (författare)
Stanford, JL (författare)
Thibodeau, SN (författare)
McDonnell, SK (författare)
Schaid, DJ (författare)
Maier, C (författare)
Vogel, W (författare)
Luedeke, M (författare)
Herkommer, K (författare)
Kibel, AS (författare)
Cybulski, C (författare)
Wokolorczyk, D (författare)
Kluzniak, W (författare)
Cannon-Albright, L (författare)
Teerlink, C (författare)
Brenner, H (författare)
Dieffenbach, AK (författare)
Arndt, V (författare)
Park, JY (författare)
Sellers, TA (författare)
Lin, HY (författare)
Slavov, C (författare)
Kaneva, R (författare)
Mitev, V (författare)
Batra, J (författare)
Spurdle, A (författare)
Clements, JAKarolinska Institutet (författare)
Teixeira, MR (författare)
Pandha, H (författare)
Michael, A (författare)
Paulo, P (författare)
Maia, S (författare)
Kierzek, A (författare)
Conti, DV (författare)
Albanes, D (författare)
Berg, C (författare)
Berndt, SI (författare)
Campa, D (författare)
Crawford, ED (författare)
Diver, WR (författare)
Gapstur, SM (författare)
Gaziano, JM (författare)
Giovannucci, E (författare)
Hoover, R (författare)
Hunter, DJ (författare)
Johansson, M (författare)
Kraft, P (författare)
Le Marchand, L (författare)
Lindstrom, S (författare)
Navarro, C (författare)
Overvad, K (författare)
Riboli, E (författare)
Siddiq, A (författare)
Stevens, VL (författare)
Trichopoulos, D (författare)
Vineis, P (författare)
Yeager, M (författare)
Trynka, G (författare)
Raychaudhuri, S (författare)
Schumacher, FR (författare)
Price, AL (författare)
Freedman, ML (författare)
Haiman, CA (författare)
Pasaniuc, B (författare)
Cook, M (författare)
Guy, M (författare)
Govindasami, K (författare)
Leongamornlert, D (författare)
Sawyer, EJ (författare)
Wilkinson, R (författare)
Saunders, EJ (författare)
Tymrakiewicz, M (författare)
Dadaev, T (författare)
Morgan, A (författare)
Fisher, C (författare)
Hazel, S (författare)
Livni, N (författare)
Lophatananon, A (författare)
Pedersen, J (författare)
Hopper, JL (författare)
Adolfson, JKarolinska Institutet (författare)
Stattin, P (författare)
Johansson, JE (författare)
Cavalli-Bjoerkman, C (författare)
Karlsson, A (författare)
Broms, M (författare)
Auvinen, A (författare)
Kujala, P (författare)
Maeaettaenen, L (författare)
Murtola, T (författare)
Taari, K (författare)
Weischer, M (författare)
Nielsen, SF (författare)
Klarskov, P (författare)
Roder, A (författare)
Iversen, P (författare)
Wallinder, H (författare)
Gustafsson, S (författare)
Cox, A (författare)
Brown, P (författare)
George, A (författare)
Marsden, G (författare)
Lane, A (författare)
Davis, M (författare)
Zheng, W (författare)
Signorello, LB (författare)
Blot, WJ (författare)
Tillmans, L (författare)
Riska, S (författare)
Wang, L (författare)
Rinckleb, A (författare)
Lubiski, J (författare)
Stegmaier, C (författare)
Pow-Sang, J (författare)
Park, H (författare)
Radlein, S (författare)
Rincon, M (författare)
Haley, J (författare)
Zachariah, B (författare)
Kachakova, D (författare)
Popov, E (författare)
Mitkova, A (författare)
Vlahova, A (författare)
Dikov, T (författare)
Christova, S (författare)
Heathcote, P (författare)
Wood, G (författare)
Malone, G (författare)
Saunders, P (författare)
Eckert, A (författare)
Yeadon, T (författare)
Kerr, K (författare)
Collins, A (författare)
Turner, M (författare)
Srinivasan, S (författare)
Kedda, MA (författare)
Alexander, K (författare)
Omara, T (författare)
Wu, HH (författare)
Henrique, R (författare)
Pinto, P (författare)
Santos, J (författare)
Barros-Silva, J (författare)
Karolinska InstitutetEnheten för biobanksforskning (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature communications: Springer Science and Business Media LLC7, s. 10979-2041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature communications (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Gusev, A; Shi, H; Kichaev, G; Pomerantz, M; Li, F; Long, HW; visa fler...; Ingles, SA; Kittles, RA; Strom, SS; Rybicki, BA; Nemesure, B; Isaacs, WB; Zheng, W; Pettaway, CA; Yeboah, ED; Tettey, Y; Biritwum, RB; Adjei, AA; Tay, E; Truelove, A; Niwa, S; Chokkalingam, AP; John, EM; Murphy, AB; Signorello, LB; Carpten, J; Leske, MC; Wu, SY; Johansson, Matti ...; Neslund-Dudas, C; Hsing, AW; Chu, L; Goodman, PJ; Klein, EA; Witte, JS; Casey, G; Kaggwa, S; Cook, MB; Stram, DO; Blot, WJ; Eeles, RA; Easton, D; Kote-Jarai, Z; Al Olama, AA; Benlloch, S; Muir, K; Giles, GG; Southey, MC; Fitzgerald, LM; Gronberg, H; Wiklund, F; Aly, M; Henderson, BE; Schleutker, J; Wahlfors, T; Tammela, TLJ; Nordestgaard, BG; Key, TJ; Travis, RC; Neal, DE; Donovan, JL; Hamdy, FC; Pharoah, P; Pashayan, N; Khaw, KT; Stanford, JL; Thibodeau, SN; McDonnell, SK; Schaid, DJ; Maier, C; Vogel, W; Luedeke, M; Herkommer, K; Kibel, AS; Cybulski, C; Wokolorczyk, D; Kluzniak, W; Cannon-Albright, ...; Teerlink, C; Brenner, H; Dieffenbach, AK; Arndt, V; Park, JY; Sellers, TA; Lin, HY; Slavov, C; Kaneva, R; Mitev, V; Batra, J; Spurdle, A; Clements, JA; Teixeira, MR; Pandha, H; Michael, A; Paulo, P; Maia, S; Kierzek, A; Conti, DV; Albanes, D; Berg, C; Berndt, SI; Campa, D; Crawford, ED; Diver, WR; Gapstur, SM; Gaziano, JM; Giovannucci, E; Hoover, R; Hunter, DJ; Johansson, M; Kraft, P; Le Marchand, L; Lindstrom, S; Navarro, C; Overvad, K; Riboli, E; Siddiq, A; Stevens, VL; Trichopoulos, D; Vineis, P; Yeager, M; Trynka, G; Raychaudhuri, S; Schumacher, FR; Price, AL; Freedman, ML; Haiman, CA; Pasaniuc, B; Cook, M; Guy, M; Govindasami, K; Leongamornlert, ...; Sawyer, EJ; Wilkinson, R; Saunders, EJ; Tymrakiewicz, M; Dadaev, T; Morgan, A; Fisher, C; Hazel, S; Livni, N; Lophatananon, A; Pedersen, J; Hopper, JL; Adolfson, J; Stattin, P; Johansson, JE; Cavalli-Bjoerkma ...; Karlsson, A; Broms, M; Auvinen, A; Kujala, P; Maeaettaenen, L; Murtola, T; Taari, K; Weischer, M; Nielsen, SF; Klarskov, P; Roder, A; Iversen, P; Wallinder, H; Gustafsson, S; Cox, A; Brown, P; George, A; Marsden, G; Lane, A; Davis, M; Tillmans, L; Riska, S; Wang, L; Rinckleb, A; Lubiski, J; Stegmaier, C; Pow-Sang, J; Park, H; Radlein, S; Rincon, M; Haley, J; Zachariah, B; Kachakova, D; Popov, E; Mitkova, A; Vlahova, A; Dikov, T; Christova, S; Heathcote, P; Wood, G; Malone, G; Saunders, P; Eckert, A; Yeadon, T; Kerr, K; Collins, A; Turner, M; Srinivasan, S; Kedda, MA; Alexander, K; Omara, T; Wu, HH; Henrique, R; Pinto, P; Santos, J; Barros-Silva, J; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Artiklar i publikationen: Nature communica ...

Av lärosätet: Karolinska Institutet; Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se