SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Adachi T)
 

Sökning: WFRF:(Adachi T) > The whole blood tra...

The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force

Wang, QBS (författare)
Edahiro, R (författare)
Namkoong, H (författare)
visa fler...
Hasegawa, T (författare)
Shirai, Y (författare)
Sonehara, K (författare)
Tanaka, H (författare)
Lee, H (författare)
Saiki, R (författare)
Hyugaji, T (författare)
Shimizu, E (författare)
Katayama, K (författare)
Kanai, M (författare)
Naito, T (författare)
Sasa, N (författare)
Yamamoto, K (författare)
Kato, Y (författare)
Morita, T (författare)
Takahashi, K (författare)
Harada, N (författare)
Naito, T (författare)
Hiki, M (författare)
Matsushita, Y (författare)
Takagi, H (författare)
Ichikawa, M (författare)
Nakamura, A (författare)
Harada, S (författare)
Sandhu, Y (författare)
Kabata, H (författare)
Masaki, K (författare)
Kamata, H (författare)
Ikemura, S (författare)
Chubachi, S (författare)
Okamori, S (författare)
Terai, H (författare)
Morita, A (författare)
Asakura, T (författare)
Sasaki, J (författare)
Morisaki, H (författare)
Uwamino, Y (författare)
Nanki, K (författare)
Uchida, S (författare)
Uno, S (författare)
Nishimura, T (författare)
Ishiguro, T (författare)
Isono, T (författare)
Shibata, S (författare)
Matsui, Y (författare)
Hosoda, C (författare)
Takano, K (författare)
Nishida, T (författare)
Kobayashi, Y (författare)
Takaku, Y (författare)
Takayanagi, N (författare)
Ueda, S (författare)
Tada, A (författare)
Miyawaki, M (författare)
Yamamoto, M (författare)
Yoshida, E (författare)
Hayashi, R (författare)
Nagasaka, T (författare)
Arai, S (författare)
Kaneko, Y (författare)
Sasaki, K (författare)
Tagaya, E (författare)
Kawana, M (författare)
Arimura, K (författare)
Takahashi, K (författare)
Anzai, T (författare)
Ito, S (författare)
Endo, A (författare)
Uchimura, Y (författare)
Miyazaki, Y (författare)
Honda, T (författare)
Tateishi, T (författare)
Tohda, S (författare)
Ichimura, N (författare)
Sonobe, K (författare)
Sassa, CT (författare)
Nakajima, J (författare)
Nakano, Y (författare)
Nakajima, Y (författare)
Anan, R (författare)
Arai, R (författare)
Kurihara, Y (författare)
Harada, Y (författare)
Nishio, K (författare)
Ueda, T (författare)
Azuma, M (författare)
Saito, R (författare)
Sado, T (författare)
Miyazaki, Y (författare)
Sato, R (författare)
Haruta, Y (författare)
Nagasaki, T (författare)
Yasui, Y (författare)
Hasegawa, Y (författare)
Mutoh, Y (författare)
Kimura, T (författare)
Sato, T (författare)
Takei, R (författare)
Hagimoto, S (författare)
Noguchi, Y (författare)
Yamano, Y (författare)
Sasano, H (författare)
Ota, S (författare)
Nakamori, Y (författare)
Yoshiya, K (författare)
Saito, F (författare)
Yoshihara, T (författare)
Wada, D (författare)
Iwamura, H (författare)
Kanayama, S (författare)
Maruyama, S (författare)
Yoshiyama, T (författare)
Ohta, K (författare)
Kokuto, H (författare)
Ogata, H (författare)
Tanaka, Y (författare)
Arakawa, K (författare)
Shimoda, M (författare)
Osawa, T (författare)
Tateno, H (författare)
Hase, I (författare)
Yoshida, S (författare)
Suzuki, S (författare)
Kawada, M (författare)
Horinouchi, H (författare)
Saito, F (författare)
Mitamura, K (författare)
Hagihara, M (författare)
Ochi, J (författare)
Uchida, T (författare)
Baba, R (författare)
Arai, D (författare)
Ogura, T (författare)
Takahashi, H (författare)
Hagiwara, S (författare)
Nagao, G (författare)
Konishi, S (författare)
Nakachi, I (författare)
Murakami, K (författare)
Yamada, M (författare)
Sugiura, H (författare)
Sano, H (författare)
Matsumoto, S (författare)
Kimura, N (författare)
Ono, Y (författare)
Baba, H (författare)
Suzuki, Y (författare)
Nakayama, S (författare)
Masuzawa, K (författare)
Namba, S (författare)
Shiroyama, T (författare)
Noda, Y (författare)
Niitsu, T (författare)
Adachi, Y (författare)
Enomoto, T (författare)
Amiya, S (författare)
Hara, R (författare)
Yamaguchi, Y (författare)
Murakami, T (författare)
Kuge, T (författare)
Matsumoto, K (författare)
Yamamoto, Y (författare)
Yamamoto, M (författare)
Yoneda, M (författare)
Tomono, K (författare)
Kato, K (författare)
Hirata, H (författare)
Takeda, Y (författare)
Koh, H (författare)
Manabe, T (författare)
Funatsu, Y (författare)
Ito, F (författare)
Fukui, T (författare)
Shinozuka, K (författare)
Kohashi, S (författare)
Miyazaki, M (författare)
Shoko, T (författare)
Kojima, M (författare)
Adachi, T (författare)
Ishikawa, M (författare)
Takahashi, K (författare)
Inoue, T (författare)
Hirano, T (författare)
Kobayashi, K (författare)
Takaoka, H (författare)
Watanabe, K (författare)
Miyazawa, N (författare)
Kimura, Y (författare)
Sado, R (författare)
Sugimoto, H (författare)
Kamiya, A (författare)
Kuwahara, N (författare)
Fujiwara, A (författare)
Matsunaga, T (författare)
Sato, Y (författare)
Okada, T (författare)
Hirai, Y (författare)
Kawashima, H (författare)
Narita, A (författare)
Niwa, K (författare)
Sekikawa, Y (författare)
Nishi, K (författare)
Nishitsuji, M (författare)
Tani, M (författare)
Suzuki, J (författare)
Nakatsumi, H (författare)
Ogura, T (författare)
Kitamura, H (författare)
Hagiwara, E (författare)
Murohashi, K (författare)
Okabayashi, H (författare)
Mochimaru, T (författare)
Nukaga, S (författare)
Satomi, R (författare)
Oyamada, Y (författare)
Mori, N (författare)
Baba, T (författare)
Fukui, Y (författare)
Odate, M (författare)
Mashimo, S (författare)
Makino, Y (författare)
Yagi, K (författare)
Hashiguchi, M (författare)
Kagyo, J (författare)
Shiomi, T (författare)
Fuke, S (författare)
Saito, H (författare)
Tsuchida, T (författare)
Fujitani, S (författare)
Takita, M (författare)
Morikawa, D (författare)
Yoshida, T (författare)
Izumo, T (författare)
Inomata, M (författare)
Kuse, N (författare)
Awano, N (författare)
Tone, M (författare)
Ito, A (författare)
Nakamura, Y (författare)
Hoshino, K (författare)
Maruyama, J (författare)
Ishikura, H (författare)
Takata, T (författare)
Odani, T (författare)
Amishima, M (författare)
Hattori, T (författare)
Shichinohe, Y (författare)
Kagaya, T (författare)
Kita, T (författare)
Ohta, K (författare)
Sakagami, S (författare)
Koshida, K (författare)
Hayashi, K (författare)
Shimizu, T (författare)
Kozu, Y (författare)
Hiranuma, H (författare)
Gon, Y (författare)
Izumi, N (författare)
Nagata, K (författare)
Ueda, K (författare)
Taki, R (författare)
Hanada, S (författare)
Kawamura, K (författare)
Ichikado, K (författare)
Nishiyama, K (författare)
Muranaka, H (författare)
Nakamura, K (författare)
Hashimoto, N (författare)
Wakahara, K (författare)
Koji, S (författare)
Omote, N (författare)
Ando, A (författare)
Kodama, N (författare)
Kaneyama, Y (författare)
Maeda, S (författare)
Kuraki, T (författare)
Matsumoto, T (författare)
Yokote, K (författare)
Nakada, TA (författare)
Abe, R (författare)
Oshima, T (författare)
Shimada, T (författare)
Harada, M (författare)
Takahashi, T (författare)
Ono, H (författare)
Sakurai, T (författare)
Shibusawa, T (författare)
Kimizuka, Y (författare)
Kawana, A (författare)
Sano, T (författare)
Watanabe, C (författare)
Suematsu, R (författare)
Sageshima, H (författare)
Yoshifuji, A (författare)
Ito, K (författare)
Takahashi, S (författare)
Ishioka, K (författare)
Nakamura, M (författare)
Masuda, M (författare)
Wakabayashi, A (författare)
Watanabe, H (författare)
Ueda, S (författare)
Nishikawa, M (författare)
Chihara, Y (författare)
Takeuchi, M (författare)
Onoi, K (författare)
Shinozuka, J (författare)
Sueyoshi, A (författare)
Nagasaki, Y (författare)
Okamoto, M (författare)
Ishihara, S (författare)
Shimo, M (författare)
Tokunaga, Y (författare)
Kusaka, Y (författare)
Ohba, T (författare)
Isogai, S (författare)
Ogawa, A (författare)
Inoue, T (författare)
Fukuyama, S (författare)
Eriguchi, Y (författare)
Yonekawa, A (författare)
Kan-o, K (författare)
Matsumoto, K (författare)
Kanaoka, K (författare)
Ihara, S (författare)
Komuta, K (författare)
Inoue, Y (författare)
Chiba, S (författare)
Yamagata, K (författare)
Hiramatsu, Y (författare)
Kai, H (författare)
Asano, K (författare)
Oguma, T (författare)
Ito, Y (författare)
Hashimoto, S (författare)
Yamasaki, M (författare)
Kasamatsu, Y (författare)
Komase, Y (författare)
Hida, N (författare)
Tsuburai, T (författare)
Oyama, B (författare)
Takada, M (författare)
Kanda, H (författare)
Kitagawa, Y (författare)
Fukuta, T (författare)
Miyake, T (författare)
Yoshida, S (författare)
Ogura, S (författare)
Abe, S (författare)
Kono, Y (författare)
Togashi, Y (författare)
Takoi, H (författare)
Kikuchi, R (författare)
Ogawa, S (författare)
Ogata, T (författare)
Ishihara, S (författare)
Kanehiro, A (författare)
Ozaki, S (författare)
Fuchimoto, Y (författare)
Wada, S (författare)
Fujimoto, N (författare)
Nishiyama, K (författare)
Terashima, M (författare)
Beppu, S (författare)
Yoshida, K (författare)
Narumoto, O (författare)
Nagai, H (författare)
Ooshima, N (författare)
Motegi, M (författare)
Umeda, A (författare)
Miyagawa, K (författare)
Shimada, H (författare)
Endo, M (författare)
Ohira, Y (författare)
Watanabe, M (författare)
Inoue, S (författare)
Igarashi, A (författare)
Sato, M (författare)
Sagara, H (författare)
Tanaka, A (författare)
Ohta, S (författare)
Kimura, T (författare)
Shibata, Y (författare)
Tanino, Y (författare)
Nikaido, T (författare)
Minemura, H (författare)
Sato, Y (författare)
Yamada, Y (författare)
Hashino, T (författare)
Shinoki, M (författare)
Iwagoe, H (författare)
Takahashi, H (författare)
Fujii, K (författare)
Kishi, H (författare)
Kanai, M (författare)
Imamura, T (författare)
Yamashita, T (författare)
Yatomi, M (författare)
Maeno, T (författare)
Hayashi, S (författare)
Takahashi, M (författare)
Kuramochi, M (författare)
Kamimaki, I (författare)
Tominaga, Y (författare)
Ishii, T (författare)
Utsugi, M (författare)
Ono, A (författare)
Tanaka, T (författare)
Kashiwada, T (författare)
Fujita, K (författare)
Saito, Y (författare)
Seike, M (författare)
Watanabe, H (författare)
Matsuse, H (författare)
Kodaka, N (författare)
Nakano, C (författare)
Oshio, T (författare)
Hirouchi, T (författare)
Makino, S (författare)
Egi, M (författare)
Omae, Y (författare)
Nannya, Y (författare)
Ueno, T (författare)
Takano, T (författare)
Katayama, K (författare)
Ai, M (författare)
Kumanogoh, A (författare)
Sato, T (författare)
Hasegawa, N (författare)
Tokunaga, K (författare)
Ishii, M (författare)
Koike, R (författare)
Kitagawa, Y (författare)
Kimura, A (författare)
Imoto, S (författare)
Miyano, S (författare)
Ogawa, S (författare)
Kanai, T (författare)
Fukunaga, K (författare)
Okada, Y (författare)
visa färre...
2022-08-22
2022
Engelska.
Ingår i: Nature communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 13:1, s. 4830-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Coronavirus disease 2019 (COVID-19) is a recently-emerged infectious disease that has caused millions of deaths, where comprehensive understanding of disease mechanisms is still unestablished. In particular, studies of gene expression dynamics and regulation landscape in COVID-19 infected individuals are limited. Here, we report on a thorough analysis of whole blood RNA-seq data from 465 genotyped samples from the Japan COVID-19 Task Force, including 359 severe and 106 non-severe COVID-19 cases. We discover 1169 putative causal expression quantitative trait loci (eQTLs) including 34 possible colocalizations with biobank fine-mapping results of hematopoietic traits in a Japanese population, 1549 putative causal splice QTLs (sQTLs; e.g. two independent sQTLs at TOR1AIP1), as well as biologically interpretable trans-eQTL examples (e.g., REST and STING1), all fine-mapped at single variant resolution. We perform differential gene expression analysis to elucidate 198 genes with increased expression in severe COVID-19 cases and enriched for innate immune-related functions. Finally, we evaluate the limited but non-zero effect of COVID-19 phenotype on eQTL discovery, and highlight the presence of COVID-19 severity-interaction eQTLs (ieQTLs; e.g., CLEC4C and MYBL2). Our study provides a comprehensive catalog of whole blood regulatory variants in Japanese, as well as a reference for transcriptional landscapes in response to COVID-19 infection.

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Wang, QBS
Edahiro, R
Namkoong, H
Hasegawa, T
Shirai, Y
Sonehara, K
visa fler...
Tanaka, H
Lee, H
Saiki, R
Hyugaji, T
Shimizu, E
Katayama, K
Kanai, M
Naito, T
Sasa, N
Yamamoto, K
Kato, Y
Morita, T
Takahashi, K
Harada, N
Hiki, M
Matsushita, Y
Takagi, H
Ichikawa, M
Nakamura, A
Harada, S
Sandhu, Y
Kabata, H
Masaki, K
Kamata, H
Ikemura, S
Chubachi, S
Okamori, S
Terai, H
Morita, A
Asakura, T
Sasaki, J
Morisaki, H
Uwamino, Y
Nanki, K
Uchida, S
Uno, S
Nishimura, T
Ishiguro, T
Isono, T
Shibata, S
Matsui, Y
Hosoda, C
Takano, K
Nishida, T
Kobayashi, Y
Takaku, Y
Takayanagi, N
Ueda, S
Tada, A
Miyawaki, M
Yamamoto, M
Yoshida, E
Hayashi, R
Nagasaka, T
Arai, S
Kaneko, Y
Sasaki, K
Tagaya, E
Kawana, M
Arimura, K
Anzai, T
Ito, S
Endo, A
Uchimura, Y
Miyazaki, Y
Honda, T
Tateishi, T
Tohda, S
Ichimura, N
Sonobe, K
Sassa, CT
Nakajima, J
Nakano, Y
Nakajima, Y
Anan, R
Arai, R
Kurihara, Y
Harada, Y
Nishio, K
Ueda, T
Azuma, M
Saito, R
Sado, T
Sato, R
Haruta, Y
Nagasaki, T
Yasui, Y
Hasegawa, Y
Mutoh, Y
Kimura, T
Sato, T
Takei, R
Hagimoto, S
Noguchi, Y
Yamano, Y
Sasano, H
Ota, S
Nakamori, Y
Yoshiya, K
Saito, F
Yoshihara, T
Wada, D
Iwamura, H
Kanayama, S
Maruyama, S
Yoshiyama, T
Ohta, K
Kokuto, H
Ogata, H
Tanaka, Y
Arakawa, K
Shimoda, M
Osawa, T
Tateno, H
Hase, I
Yoshida, S
Suzuki, S
Kawada, M
Horinouchi, H
Mitamura, K
Hagihara, M
Ochi, J
Uchida, T
Baba, R
Arai, D
Ogura, T
Takahashi, H
Hagiwara, S
Nagao, G
Konishi, S
Nakachi, I
Murakami, K
Yamada, M
Sugiura, H
Sano, H
Matsumoto, S
Kimura, N
Ono, Y
Baba, H
Suzuki, Y
Nakayama, S
Masuzawa, K
Namba, S
Shiroyama, T
Noda, Y
Niitsu, T
Adachi, Y
Enomoto, T
Amiya, S
Hara, R
Yamaguchi, Y
Murakami, T
Kuge, T
Matsumoto, K
Yamamoto, Y
Yoneda, M
Tomono, K
Kato, K
Hirata, H
Takeda, Y
Koh, H
Manabe, T
Funatsu, Y
Ito, F
Fukui, T
Shinozuka, K
Kohashi, S
Miyazaki, M
Shoko, T
Kojima, M
Adachi, T
Ishikawa, M
Inoue, T
Hirano, T
Kobayashi, K
Takaoka, H
Watanabe, K
Miyazawa, N
Kimura, Y
Sado, R
Sugimoto, H
Kamiya, A
Kuwahara, N
Fujiwara, A
Matsunaga, T
Sato, Y
Okada, T
Hirai, Y
Kawashima, H
Narita, A
Niwa, K
Sekikawa, Y
Nishi, K
Nishitsuji, M
Tani, M
Suzuki, J
Nakatsumi, H
Kitamura, H
Hagiwara, E
Murohashi, K
Okabayashi, H
Mochimaru, T
Nukaga, S
Satomi, R
Oyamada, Y
Mori, N
Baba, T
Fukui, Y
Odate, M
Mashimo, S
Makino, Y
Yagi, K
Hashiguchi, M
Kagyo, J
Shiomi, T
Fuke, S
Saito, H
Tsuchida, T
Fujitani, S
Takita, M
Morikawa, D
Yoshida, T
Izumo, T
Inomata, M
Kuse, N
Awano, N
Tone, M
Ito, A
Nakamura, Y
Hoshino, K
Maruyama, J
Ishikura, H
Takata, T
Odani, T
Amishima, M
Hattori, T
Shichinohe, Y
Kagaya, T
Kita, T
Sakagami, S
Koshida, K
Hayashi, K
Shimizu, T
Kozu, Y
Hiranuma, H
Gon, Y
Izumi, N
Nagata, K
Ueda, K
Taki, R
Hanada, S
Kawamura, K
Ichikado, K
Nishiyama, K
Muranaka, H
Nakamura, K
Hashimoto, N
Wakahara, K
Koji, S
Omote, N
Ando, A
Kodama, N
Kaneyama, Y
Maeda, S
Kuraki, T
Matsumoto, T
Yokote, K
Nakada, TA
Abe, R
Oshima, T
Shimada, T
Harada, M
Takahashi, T
Ono, H
Sakurai, T
Shibusawa, T
Kimizuka, Y
Kawana, A
Sano, T
Watanabe, C
Suematsu, R
Sageshima, H
Yoshifuji, A
Ito, K
Takahashi, S
Ishioka, K
Nakamura, M
Masuda, M
Wakabayashi, A
Watanabe, H
Nishikawa, M
Chihara, Y
Takeuchi, M
Onoi, K
Shinozuka, J
Sueyoshi, A
Nagasaki, Y
Okamoto, M
Ishihara, S
Shimo, M
Tokunaga, Y
Kusaka, Y
Ohba, T
Isogai, S
Ogawa, A
Fukuyama, S
Eriguchi, Y
Yonekawa, A
Kan-o, K
Kanaoka, K
Ihara, S
Komuta, K
Inoue, Y
Chiba, S
Yamagata, K
Hiramatsu, Y
Kai, H
Asano, K
Oguma, T
Ito, Y
Hashimoto, S
Yamasaki, M
Kasamatsu, Y
Komase, Y
Hida, N
Tsuburai, T
Oyama, B
Takada, M
Kanda, H
Kitagawa, Y
Fukuta, T
Miyake, T
Ogura, S
Abe, S
Kono, Y
Togashi, Y
Takoi, H
Kikuchi, R
Ogawa, S
Ogata, T
Kanehiro, A
Ozaki, S
Fuchimoto, Y
Wada, S
Fujimoto, N
Terashima, M
Beppu, S
Yoshida, K
Narumoto, O
Nagai, H
Ooshima, N
Motegi, M
Umeda, A
Miyagawa, K
Shimada, H
Endo, M
Ohira, Y
Watanabe, M
Inoue, S
Igarashi, A
Sato, M
Sagara, H
Tanaka, A
Ohta, S
Shibata, Y
Tanino, Y
Nikaido, T
Minemura, H
Yamada, Y
Hashino, T
Shinoki, M
Iwagoe, H
Fujii, K
Kishi, H
Imamura, T
Yamashita, T
Yatomi, M
Maeno, T
Hayashi, S
Takahashi, M
Kuramochi, M
Kamimaki, I
Tominaga, Y
Ishii, T
Utsugi, M
Ono, A
Tanaka, T
Kashiwada, T
Fujita, K
Saito, Y
Seike, M
Matsuse, H
Kodaka, N
Nakano, C
Oshio, T
Hirouchi, T
Makino, S
Egi, M
Omae, Y
Nannya, Y
Ueno, T
Takano, T
Ai, M
Kumanogoh, A
Hasegawa, N
Tokunaga, K
Ishii, M
Koike, R
Kimura, A
Imoto, S
Miyano, S
Kanai, T
Fukunaga, K
Okada, Y
visa färre...
Artiklar i publikationen
Nature communica ...
Av lärosätet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy