SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:79f2cada-6cc2-4680-85c7-d0f995e56dc1"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:79f2cada-6cc2-4680-85c7-d0f995e56dc1" > Direct Transcriptio...

Direct Transcriptional Consequences of Somatic Mutation in Breast Cancer

Shlien, Adam (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Raine, Keiran (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Fuligni, Fabio (författare)
Hospital for Sick Children, Toronto
visa fler...
Arnold, Roland (författare)
Hospital for Sick Children, Toronto
Nik-Zainal, Serena (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Dronov, Serge (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Mamanova, Lira (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Rosic, Andrej (författare)
Hospital for Sick Children, Toronto
Ju, Young Seok (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Cooke, Susanna L. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Ramakrishna, Manasa (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Papaemmanuil, Elli (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Davies, Helen R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Tarpey, Patrick S. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Van Loo, Peter (författare)
Catholic University of Leuven,Wellcome Trust Sanger Institute
Wedge, David C. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Jones, David R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Martin, Sancha (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Marshall, John (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Anderson, Elizabeth (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Hardy, Claire (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Barbashina, Violetta (författare)
Institute of Cancer Research London
Aparicio, Samuel A J R (författare)
British Columbia Cancer Agency
Sauer, Torill (författare)
Oslo university hospital
Garred, Øystein (författare)
Oslo university hospital
Vincent-Salomon, Anne (författare)
Curie Institute, Paris
Mariani, Odette (författare)
Curie Institute, Paris
Boyault, Sandrine (författare)
Centre Léon Bérard
Fatima, Aquila (författare)
Dana-Farber Cancer Institute
Langerød, Anita (författare)
University of Oslo
Borg, Åke (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Thomas, Gilles (författare)
Centre Léon Bérard
Richardson, Andrea L. (författare)
Dana-Farber Cancer Institute
Børresen-Dale, Anne Lise (författare)
Oslo university hospital,University of Oslo
Polyak, Kornelia (författare)
Dana-Farber Cancer Institute
Stratton, Michael R. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Campbell, Peter J. (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute,Addenbrooke's Hospital,University of Cambridge
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2016
2016
Engelska 15 s.
Ingår i: Cell Reports. - : Elsevier BV. - 2211-1247. ; 16:7, s. 2032-2046
Relaterad länk:
http://dx.doi.org/10... (free)
visa fler...
http://www.cell.com/...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Disordered transcriptomes of cancer encompass direct effects of somatic mutation on transcription, coordinated secondary pathway alterations, and increased transcriptional noise. To catalog the rules governing how somatic mutation exerts direct transcriptional effects, we developed an exhaustive pipeline for analyzing RNA sequencing data, which we integrated with whole genomes from 23 breast cancers. Using X-inactivation analyses, we found that cancer cells are more transcriptionally active than intermixed stromal cells. This is especially true in estrogen receptor (ER)-negative tumors. Overall, 59% of substitutions were expressed. Nonsense mutations showed lower expression levels than expected, with patterns characteristic of nonsense-mediated decay. 14% of 4,234 rearrangements caused transcriptional abnormalities, including exon skips, exon reusage, fusions, and premature polyadenylation. We found productive, stable transcription from sense-to-antisense gene fusions and gene-to-intergenic rearrangements, suggesting that these mutation classes drive more transcriptional disruption than previously suspected. Systematic integration of transcriptome with genome data reveals the rules by which transcriptional machinery interprets somatic mutation.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy