Loci associated with ischaemic stroke and its subtypes (SiGN): a genome-wide association study.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/247952" > Loci associated wit...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Loci associated with ischaemic stroke and its subtypes (SiGN): a genome-wide association study.

Pulit, SL (författare): University Medical Center Utrecht

McArdle, PF (författare)

Wong, Q (författare)

visa fler...

Malik, R (författare)

Gwinn, K (författare)

Achterberg, S (författare)

Algra, A (författare)

Amouyel, P (författare)

Anderson, CD (författare)

Arnett, DK (författare)

Arsava, EM (författare)

Attia, J (författare)

Ay, H (författare)

Tatlisumak, Turgut (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology

Battey, T (författare)

Benavente, OR (författare)

Bevan, S (författare)

Biffi, A (författare)

Jern, Christina, 1962 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

Blanton, SH (författare)

Boncoraglio, GB (författare)

Brown Jr, RD (författare)

Ilinca, Andreea (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Klinisk neurogenetik,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups,Clinical Neurogenetics,Landskrona Hospital

Carrera, C (författare)

Chapman Smith, SN (författare)

Chasman, DI (författare)

Chauhan, G (författare)

Chen, W-M (författare)

Cheng, Y-C (författare)

Chong, M (författare)

Cloonan, LK (författare)

Cole, JW (författare)

Cotlarciuc, I (författare)

Cruchaga, C (författare)

Cuadrado-Godia, E (författare)

Dave, T (författare)

Dawson, J (författare)

Debette, S (författare)

Delavaran, Hossein (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Dell, CA (författare)

Dichgans, M (författare)

Doheny, KF (författare)

Dong, C (författare)

Duggan, DJ (författare)

Engström, Gunnar (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Evans, MK (författare)

Estivill Pallejà, X (författare)

Faul, JD (författare)

Fernández-Cadenas, I (författare)

Fornage, M (författare)

Frossard, PM (författare)

Furie, K (författare)

Gamble, DM (författare)

Gieger, C (författare)

Giese, A-K (författare)

Giralt-Steinhauer, E (författare)

González, HM (författare)

Goris, A (författare)

Gretarsdottir, S (författare)

Redfors, Petra (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation

Grittner, U (författare)

Gustafsson, S (författare)

Han, B (författare)

Hankey, GJ (författare)

Heitsch, L (författare)

Higgins, P (författare)

Hochberg, MC (författare)

Holliday, E (författare)

Hopewell, JC (författare)

Horenstein, RB (författare)

Howard, G (författare)

Ikram, MA (författare)

Ilinca, A (författare)

Ingelsson, E (författare)

Irvin, MR (författare)

Jackson, RD (författare)

Jern, Christina, 1962 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

Jiménez Conde, J (författare)

Johnson, JA (författare)

Jood, Katarina, 1966 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation

Söderholm, Martin (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Kaplan, R (författare)

Kappelle, LJ (författare)

Kardia, SLR (författare)

Keene, KL (författare)

Kissela, BM (författare)

Kleindorfer, DO (författare)

Koblar, S (författare)

Labovitz, D (författare)

Launer, LJ (författare)

Laurie, CC (författare)

Laurie, CA (författare)

Hyunkyu Lee, C (författare)

Lee, J-M (författare)

Lehm, M (författare)

Lemmens, R (författare)

Levi, C (författare)

Leys, D (författare)

Lindgren, Arne (författare): Lund University,Lunds universitet,Neurologi, Lund,Sektion IV,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Klinisk strokeforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neurology, Lund,Section IV,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Clinical Stroke Research Group,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Longstreth Jr, WT (författare)

Maguire, J (författare)

Manichaikul, A (författare)

Markus, HS (författare)

McClure, LA (författare)

McDonough, CW (författare)

Meisinger, C (författare)

Melander, Olle (författare): Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital

Meschia, JF (författare)

Mola-Caminal, M (författare)

Montaner, J (författare)

Mosley, TH (författare)

Müller-Nurasyid, M (författare)

Nalls, MA (författare)

O’Connell, JR (författare)

O’Donnell, M (författare)

Ois, Á (författare)

Papanicolaou, GJ (författare)

Paré, G (författare)

Reddy Peddareddygari, L (författare)

Pedersen, Annie, 1981 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik,Institute of Biomedicine, Department of Medical and Clinical Genetics

Pera, J (författare)

Peters, A (författare)

Poole, D (författare)

Psaty, BM (författare)

Rabionet, R (författare)

Raffeld, MR (författare)

Rannikmäe, K (författare)

Rasheed, A (författare)

Redfors, Petra (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Clinical Neuroscience and Rehabilitation

Reiner, AP (författare)

Rexrode, K (författare)

Ribasés, M (författare)

Rich, SS (författare)

Robberecht, W (författare)

Rodriguez-Campello, A (författare)

Rolfs, A (författare)

Roquer, J (författare)

Rose, LM (författare)

Rosenbaum, D (författare)

Rost, NS (författare)

Rothwell, PM (författare)

Rundek, T (författare)

Ryan, KA (författare)

Sacco, RL (författare)

Sale, MM (författare)

Saleheen, D (författare)

Salomaa, V (författare)

Sánchez-Mora, C (författare)

Oliver Schmidt, C (författare)

Schmidt, H (författare)

Schmidt, R (författare)

Schürks, M (författare)

Scott, R (författare)

Segal, HC (författare)

Seiler, S (författare)

Seshadri, S (författare)

Sharma, P (författare)

Shuldiner, AR (författare)

Silver, B (författare)

Slowik, A (författare)

Smith, JA (författare)

Söderholm, M (författare)

Soriano, C (författare)

Sparks, MJ (författare)

Stanne, Tara M, 1979 (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology

Stefansson, K (författare)

Stine, OC (författare)

Strauch, K (författare)

Sturm, J (författare)

Sudlow, CLM (författare)

Tajuddin, SM (författare)

Talbert, RL (författare)

Tatlisumak, Turgut (författare): Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi,Institute of Neuroscience and Physiology

Thijs, V (författare)

Thorleifsson, G (författare)

Thorsteindottir, U (författare)

Tiedt, S (författare)

Traylor, M (författare)

Trompet, S (författare)

Valant, V (författare)

Waldenberger, M (författare)

Walters, M (författare)

Wang, L (författare)

Wassertheil-Smoller, S (författare)

Weir, DR (författare)

Wiggins, KL (författare)

Williams, SR (författare)

Wloch-Kopec, D (författare)

Woo, D (författare)

Woodfield, R (författare)

Wu, O (författare)

Xu, H (författare)

Zonderman, AB (författare)

Worrall, Bradford (författare): University of Virginia School of Medicine

visa färre...

(creator_code:org_t)

2016
2016
Engelska.
Ingår i: The Lancet. Neurology. - 1474-4465. ; 15:2, s. 174-84

Relaterad länk:: http://dx.doi.org/10...; visa fler...; https://gup.ub.gu.se...; https://doi.org/10.1...; https://lup.lub.lu.s...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

The discovery of disease-associated loci through genome-wide association studies (GWAS) is the leading genetic approach to the identification of novel biological pathways underlying diseases in humans. Until recently, GWAS in ischaemic stroke have been limited by small sample sizes and have yielded few loci associated with ischaemic stroke. We did a large-scale GWAS to identify additional susceptibility genes for stroke and its subtypes.To identify genetic loci associated with ischaemic stroke, we did a two-stage GWAS. In the first stage, we included 16 851 cases with state-of-the-art phenotyping data and 32 473 stroke-free controls. Cases were aged 16 to 104 years, recruited between 1989 and 2012, and subtypes of ischaemic stroke were recorded by centrally trained and certified investigators who used the web-based protocol, Causative Classification of Stroke (CCS). We constructed case-control strata by identifying samples that were genotyped on nearly identical arrays and were of similar genetic ancestral background. We cleaned and imputed data by use of dense imputation reference panels generated from whole-genome sequence data. We did genome-wide testing to identify stroke-associated loci within each stratum for each available phenotype, and we combined summary-level results using inverse variance-weighted fixed-effects meta-analysis. In the second stage, we did in-silico lookups of 1372 single nucleotide polymorphisms identified from the first stage GWAS in 20 941 cases and 364 736 unique stroke-free controls. The ischaemic stroke subtypes of these cases had previously been established with the Trial of Org 10 172 in Acute Stroke Treatment (TOAST) classification system, in accordance with local standards. Results from the two stages were then jointly analysed in a final meta-analysis.We identified a novel locus (G allele at rs12122341) at 1p13.2 near TSPAN2 that was associated with large artery atherosclerosis-related stroke (first stage odds ratio [OR] 1·21, 95% CI 1·13-1·30, p=4·50 × 10(-8); joint OR 1·19, 1·12-1·26, p=1·30 × 10(-9)). Our results also supported robust associations with ischaemic stroke for four other loci that have been reported in previous studies, including PITX2 (first stage OR 1·39, 1·29-1·49, p=3·26 × 10(-19); joint OR 1·37, 1·30-1·45, p=2·79 × 10(-32)) and ZFHX3 (first stage OR 1·19, 1·11-1·27, p=2·93 × 10(-7); joint OR 1·17, 1·11-1·23, p=2·29 × 10(-10)) for cardioembolic stroke, and HDAC9 (first stage OR 1·29, 1·18-1·42, p=3·50 × 10(-8); joint OR 1·24, 1·15-1·33, p=4·52 × 10(-9)) for large artery atherosclerosis stroke. The 12q24 locus near ALDH2, which has previously been associated with all ischaemic stroke but not with any specific subtype, exceeded genome-wide significance in the meta-analysis of small artery stroke (first stage OR 1·20, 1·12-1·28, p=6·82 × 10(-8); joint OR 1·17, 1·11-1·23, p=2·92 × 10(-9)). Other loci associated with stroke in previous studies, including NINJ2, were not confirmed.Our results suggest that all ischaemic stroke-related loci previously implicated by GWAS are subtype specific. We identified a novel gene associated with large artery atherosclerosis stroke susceptibility. Follow-up studies will be necessary to establish whether the locus near TSPAN2 can be a target for a novel therapeutic approach to stroke prevention. In view of the subtype-specificity of the associations detected, the rich phenotyping data available in the Stroke Genetics Network (SiGN) are likely to be crucial for further genetic discoveries related to ischaemic stroke.US National Institute of Neurological Disorders and Stroke, National Institutes of Health.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Neurologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Neurology (hsv//eng)

Nyckelord

histone deacetylase 9
transcription factor Pitx2
zinc finger protein
nerve protein
tetraspanin
TSPAN2 protein, human
Article
atherosclerosis
brain ischemia
cardioembolic stroke
disease classification
gene locus
genetic association
human
meta analysis
phenotype
priority journal
single nucleotide polymorphism
adolescent
adult
aged
case control study
cerebrovascular accident
classification
cohort analysis
genetics
genome-wide association study
middle aged
procedures
very elderly
young adult
Adolescent
Adult
Aged
Aged, 80 and over
Brain Ischemia
Case-Control Studies
Cohort Studies
Genetic Loci
Genome-Wide Association Study
Humans
Middle Aged
Nerve Tissue Proteins
Stroke
Tetraspanins
Young Adult

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

The Lancet. Neurology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Pulit, SL; McArdle, PF; Wong, Q; Malik, R; Gwinn, K; Achterberg, S; visa fler...; Algra, A; Amouyel, P; Anderson, CD; Arnett, DK; Arsava, EM; Attia, J; Ay, H; Tatlisumak, Turg ...; Battey, T; Benavente, OR; Bevan, S; Biffi, A; Jern, Christina, ...; Blanton, SH; Boncoraglio, GB; Brown Jr, RD; Ilinca, Andreea; Carrera, C; Chapman Smith, S ...; Chasman, DI; Chauhan, G; Chen, W-M; Cheng, Y-C; Chong, M; Cloonan, LK; Cole, JW; Cotlarciuc, I; Cruchaga, C; Cuadrado-Godia, ...; Dave, T; Dawson, J; Debette, S; Delavaran, Hosse ...; Dell, CA; Dichgans, M; Doheny, KF; Dong, C; Duggan, DJ; Engström, Gunnar; Evans, MK; Estivill Pallejà ...; Faul, JD; Fernández-Cadena ...; Fornage, M; Frossard, PM; Furie, K; Gamble, DM; Gieger, C; Giese, A-K; Giralt-Steinhaue ...; González, HM; Goris, A; Gretarsdottir, S; Redfors, Petra; Grittner, U; Gustafsson, S; Han, B; Hankey, GJ; Heitsch, L; Higgins, P; Hochberg, MC; Holliday, E; Hopewell, JC; Horenstein, RB; Howard, G; Ikram, MA; Ilinca, A; Ingelsson, E; Irvin, MR; Jackson, RD; Jiménez Conde, J; Johnson, JA; Jood, Katarina, ...; Söderholm, Marti ...; Kaplan, R; Kappelle, LJ; Kardia, SLR; Keene, KL; Kissela, BM; Kleindorfer, DO; Koblar, S; Labovitz, D; Launer, LJ; Laurie, CC; Laurie, CA; Hyunkyu Lee, C; Lee, J-M; Lehm, M; Lemmens, R; Levi, C; Leys, D; Lindgren, Arne; Longstreth Jr, W ...; Maguire, J; Manichaikul, A; Markus, HS; McClure, LA; McDonough, CW; Meisinger, C; Melander, Olle; Meschia, JF; Mola-Caminal, M; Montaner, J; Mosley, TH; Müller-Nurasyid, ...; Nalls, MA; O’Connell, JR; O’Donnell, M; Ois, Á; Papanicolaou, GJ; Paré, G; Reddy Peddareddy ...; Pedersen, Annie, ...; Pera, J; Peters, A; Poole, D; Psaty, BM; Rabionet, R; Raffeld, MR; Rannikmäe, K; Rasheed, A; Reiner, AP; Rexrode, K; Ribasés, M; Rich, SS; Robberecht, W; Rodriguez-Campel ...; Rolfs, A; Roquer, J; Rose, LM; Rosenbaum, D; Rost, NS; Rothwell, PM; Rundek, T; Ryan, KA; Sacco, RL; Sale, MM; Saleheen, D; Salomaa, V; Sánchez-Mora, C; Oliver Schmidt, ...; Schmidt, H; Schmidt, R; Schürks, M; Scott, R; Segal, HC; Seiler, S; Seshadri, S; Sharma, P; Shuldiner, AR; Silver, B; Slowik, A; Smith, JA; Söderholm, M; Soriano, C; Sparks, MJ; Stanne, Tara M, ...; Stefansson, K; Stine, OC; Strauch, K; Sturm, J; Sudlow, CLM; Tajuddin, SM; Talbert, RL; Thijs, V; Thorleifsson, G; Thorsteindottir, ...; Tiedt, S; Traylor, M; Trompet, S; Valant, V; Waldenberger, M; Walters, M; Wang, L; Wassertheil-Smol ...; Weir, DR; Wiggins, KL; Williams, SR; Wloch-Kopec, D; Woo, D; Woodfield, R; Wu, O; Xu, H; Zonderman, AB; Worrall, Bradfor ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Neurologi

Artiklar i publikationen: The Lancet. Neur ...

Av lärosätet: Göteborgs universitet; Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se