SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:143680110"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:143680110" > Patterns of somatic...

Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes

Li, YL (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Roberts, ND (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Wala, JA (författare)
Broad Institute
visa fler...
Shapira, O (författare)
Broad Institute
Schumacher, SE (författare)
Broad Institute
Kumar, K (författare)
Broad Institute
Khurana, E (författare)
Weill Cornell Medical College, Qatar
Waszak, S (författare)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
Korbel, JO (författare)
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
Haber, JE (författare)
Brandeis University
Imielinski, M (författare)
New York Genome Center (NYCG)
Weischenfeldt, J (författare)
University of Copenhagen: Copenhagen School of Global Health
Beroukhim, R (författare)
Broad Institute
Campbell, PJ (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Akdemir, KC (författare)
Alvarez, EG (författare)
Baez-Ortega, A (författare)
Boutros, PC (författare)
Bowtell, DDL (författare)
Brors, B (författare)
Burns, KH (författare)
Chan, K (författare)
Chen, K (författare)
Cortes-Ciriano, I (författare)
Dueso-Barroso, A (författare)
Dunford, AJ (författare)
Edwards, PA (författare)
Estivill, X (författare)
Etemadmoghadam, D (författare)
Feuerbach, L (författare)
Fink, JL (författare)
Frenkel-Morgenstern, M (författare)
Garsed, DW (författare)
Gerstein, M (författare)
Gordenin, DA (författare)
Haan, D (författare)
Hess, JM (författare)
Hutter, B (författare)
Jones, DTW (författare)
Ju, YS (författare)
Kazanov, MD (författare)
Klimczak, LJ (författare)
Koh, Y (författare)
Lee, EA (författare)
Lee, JJK (författare)
Lynch, AG (författare)
Macintyre, G (författare)
Markowetz, F (författare)
Martincorena, I (författare)
Martinez-Fundichely, A (författare)
Meyerson, M (författare)
Miyano, S (författare)
Nakagawa, H (författare)
Navarro, FCP (författare)
Ossowski, S (författare)
Park, PJ (författare)
Pearson, J (författare)
Puiggros, M (författare)
Rippe, K (författare)
Roberts, SA (författare)
Rodriguez-Martin, B (författare)
Scully, R (författare)
Shackleton, M (författare)
Sidiropoulos, N (författare)
Sieverling, L (författare)
Stewart, C (författare)
Torrents, D (författare)
Tubio, JMC (författare)
Villasante, I (författare)
Waddell, N (författare)
Yang, LX (författare)
Yao, XT (författare)
Yoon, SS (författare)
Zamora, J (författare)
Zhang, CZ (författare)
Borg, Åke (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Familjär bröstcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Familial Breast Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
Ringnér, Markus (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
Staaf, Johan (creator_code:cre_t)
Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Bröst/lungcancer,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments,Breast/lungcancer,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2020-02-05
2020
Engelska.
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1476-4687 .- 0028-0836. ; 578:7793, s. 112-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • A key mutational process in cancer is structural variation, in which rearrangements delete, amplify or reorder genomic segments that range in size from kilobases to whole chromosomes1–7. Here we develop methods to group, classify and describe somatic structural variants, using data from the Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium of the International Cancer Genome Consortium (ICGC) and The Cancer Genome Atlas (TCGA), which aggregated whole-genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumour types8. Sixteen signatures of structural variation emerged. Deletions have a multimodal size distribution, assort unevenly across tumour types and patients, are enriched in late-replicating regions and correlate with inversions. Tandem duplications also have a multimodal size distribution, but are enriched in early-replicating regions—as are unbalanced translocations. Replication-based mechanisms of rearrangement generate varied chromosomal structures with low-level copy-number gains and frequent inverted rearrangements. One prominent structure consists of 2–7 templates copied from distinct regions of the genome strung together within one locus. Such cycles of templated insertions correlate with tandem duplications, and—in liver cancer—frequently activate the telomerase gene TERT. A wide variety of rearrangement processes are active in cancer, which generate complex configurations of the genome upon which selection can act.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Nyckelord

Gene Rearrangement/genetics
Genetic Variation
Genome, Human/genetics
Genomics
Humans
Mutagenesis, Insertional
Neoplasms/genetics
Telomerase/genetics

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy