Sökning: WFRF:(Hansson Oskar) >
A novel quantificat...
A novel quantification-driven proteomic strategy identifies an endogenous peptide of pleiotrophin as a new biomarker of Alzheimer's disease
-
- Skillbäck, Tobias (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
-
- Mattsson, Niklas, 1979 (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Hansson, Karl, 1985 (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
-
visa fler...
-
- Mirgorodskaya, Ekaterina (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Proteomics,Core Facilities, Proteomics
-
- Dahlén, Rahil (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
-
- van der Flier, W. (författare)
- Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
-
- Scheltens, P. (författare)
- Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
-
- Duits, F. (författare)
- Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
-
- Hansson, Oskar (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
-
- Teunissen, C. (författare)
- Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
-
- Blennow, Kaj, 1958 (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
-
- Zetterberg, Henrik, 1973 (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital,University College London
-
- Gobom, Johan (författare)
- University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-10-17
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322. ; 7
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We present a new, quantification-driven proteomic approach to identifying biomarkers. In contrast to the identification-driven approach, limited in scope to peptides that are identified by database searching in the first step, all MS data are considered to select biomarker candidates. The endopeptidome of cerebrospinal fluid from 40 Alzheimer's disease (AD) patients, 40 subjects with mild cognitive impairment, and 40 controls with subjective cognitive decline was analyzed using multiplex isobaric labeling. Spectral clustering was used to match MS/MS spectra. The top biomarker candidate cluster (215% higher in AD compared to controls, area under ROC curve = 0.96) was identified as a fragment of pleiotrophin located near the protein's C-terminus. Analysis of another cohort (n = 60 over four clinical groups) verified that the biomarker was increased in AD patients while no change in controls, Parkinson's disease or progressive supranuclear palsy was observed. The identification of the novel biomarker pleiotrophin 151-166 demonstrates that our quantification-driven proteomic approach is a promising method for biomarker discovery, which may be universally applicable in clinical proteomics.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)
Nyckelord
- cerebrospinal-fluid biomarkers
- tandem mass-spectra
- tyrosine-phosphatase beta/zeta
- mild cognitive impairment
- affin
- regulatory peptide
- molecule hb-gam
- diagnostic-criteria
- chondroitin
- sulfate
- growth
- receptor
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Skillbäck, Tobia ...
-
Mattsson, Niklas ...
-
Hansson, Karl, 1 ...
-
Mirgorodskaya, E ...
-
Dahlén, Rahil
-
van der Flier, W ...
-
visa fler...
-
Scheltens, P.
-
Duits, F.
-
Hansson, Oskar
-
Teunissen, C.
-
Blennow, Kaj, 19 ...
-
Zetterberg, Henr ...
-
Gobom, Johan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Neurovetenskaper
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Repor ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Lunds universitet