SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/259489"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/259489" > A novel quantificat...

A novel quantification-driven proteomic strategy identifies an endogenous peptide of pleiotrophin as a new biomarker of Alzheimer's disease

Skillbäck, Tobias (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
Mattsson, Niklas, 1979 (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
Hansson, Karl, 1985 (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
visa fler...
Mirgorodskaya, Ekaterina (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Proteomics,Core Facilities, Proteomics
Dahlén, Rahil (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
van der Flier, W. (författare)
Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
Scheltens, P. (författare)
Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
Duits, F. (författare)
Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
Hansson, Oskar (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk minnesforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Memory Research,Lund University Research Groups
Teunissen, C. (författare)
Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam
Blennow, Kaj, 1958 (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
Zetterberg, Henrik, 1973 (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,University College London,Sahlgrenska University Hospital
Gobom, Johan (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska University Hospital
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2017-10-17
2017
Engelska.
Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322. ; 7
Relaterad länk:
https://www.nature.c...
visa fler...
http://dx.doi.org/10... (free)
https://gup.ub.gu.se...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • We present a new, quantification-driven proteomic approach to identifying biomarkers. In contrast to the identification-driven approach, limited in scope to peptides that are identified by database searching in the first step, all MS data are considered to select biomarker candidates. The endopeptidome of cerebrospinal fluid from 40 Alzheimer's disease (AD) patients, 40 subjects with mild cognitive impairment, and 40 controls with subjective cognitive decline was analyzed using multiplex isobaric labeling. Spectral clustering was used to match MS/MS spectra. The top biomarker candidate cluster (215% higher in AD compared to controls, area under ROC curve = 0.96) was identified as a fragment of pleiotrophin located near the protein's C-terminus. Analysis of another cohort (n = 60 over four clinical groups) verified that the biomarker was increased in AD patients while no change in controls, Parkinson's disease or progressive supranuclear palsy was observed. The identification of the novel biomarker pleiotrophin 151-166 demonstrates that our quantification-driven proteomic approach is a promising method for biomarker discovery, which may be universally applicable in clinical proteomics.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Neurovetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Neurosciences (hsv//eng)

Nyckelord

cerebrospinal-fluid biomarkers
tandem mass-spectra
tyrosine-phosphatase beta/zeta
mild cognitive impairment
affin
regulatory peptide
molecule hb-gam
diagnostic-criteria
chondroitin
sulfate
growth
receptor

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy