SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-148288"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-148288" > Genome sequence and...

Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans

Haas, Brian J. (författare)
Kamoun, Sophien (författare)
Zody, Michael C. (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
visa fler...
Jiang, Rays H. Y. (författare)
Handsaker, Robert E. (författare)
Cano, Liliana M. (författare)
Grabherr, Manfred (författare)
Kodira, Chinnappa D. (författare)
Raffaele, Sylvain (författare)
Torto-Alalibo, Trudy (författare)
Bozkurt, Tolga O. (författare)
Ah-Fong, Audrey M. V. (författare)
Alvarado, Lucia (författare)
Anderson, Vicky L. (författare)
Armstrong, Miles R. (författare)
Avrova, Anna (författare)
Baxter, Laura (författare)
Beynon, Jim (författare)
Boevink, Petra C. (författare)
Bollmann, Stephanie R. (författare)
Bos, Jorunn I. B. (författare)
Bulone, Vincent (författare)
KTH,Glykovetenskap
Cai, Guohong (författare)
Cakir, Cahid (författare)
Carrington, James C. (författare)
Chawner, Megan (författare)
Conti, Lucio (författare)
Costanzo, Stefano (författare)
Ewan, Richard (författare)
Fahlgren, Noah (författare)
Fischbach, Michael A. (författare)
Fugelstad, Johanna (författare)
KTH,Glykovetenskap
Gilroy, Eleanor M. (författare)
Gnerre, Sante (författare)
Green, Pamela J. (författare)
Grenville-Briggs, Laura J. (författare)
Griffith, John (författare)
Gruenwald, Niklaus J. (författare)
Horn, Karolyn (författare)
Horner, Neil R. (författare)
Hu, Chia-Hui (författare)
Huitema, Edgar (författare)
Jeong, Dong-Hoon (författare)
Jones, Alexandra M. E. (författare)
Jones, Jonathan D. G. (författare)
Jones, Richard W. (författare)
Karlsson, Elinor K. (författare)
Kunjeti, Sridhara G. (författare)
Lamour, Kurt (författare)
Liu, Zhenyu (författare)
Ma, LiJun (författare)
MacLean, Daniel (författare)
Chibucos, Marcus C. (författare)
McDonald, Hayes (författare)
McWalters, Jessica (författare)
Meijer, Harold J. G. (författare)
Morgan, William (författare)
Morris, Paul F. (författare)
Munro, Carol A. (författare)
O'Neill, Keith (författare)
Ospina-Giraldo, Manuel (författare)
Pinzon, Andres (författare)
Pritchard, Leighton (författare)
Ramsahoye, Bernard (författare)
Ren, Qinghu (författare)
Restrepo, Silvia (författare)
Roy, Sourav (författare)
Sadanandom, Ari (författare)
Savidor, Alon (författare)
Schornack, Sebastian (författare)
Schwartz, David C. (författare)
Schumann, Ulrike D. (författare)
Schwessinger, Ben (författare)
Seyer, Lauren (författare)
Sharpe, Ted (författare)
Silvar, Cristina (författare)
Song, Jing (författare)
Studholme, David J. (författare)
Sykes, Sean (författare)
Thines, Marco (författare)
van de Vondervoort, Peter J. I. (författare)
Phuntumart, Vipaporn (författare)
Wawra, Stephan (författare)
Weide, Rob (författare)
Win, Joe (författare)
Young, Carolyn (författare)
Zhou, Shiguo (författare)
Fry, William (författare)
Meyers, Blake C. (författare)
van West, Pieter (författare)
Ristaino, Jean (författare)
Govers, Francine (författare)
Birch, Paul R. J. (författare)
Whisson, Stephen C. (författare)
Judelson, Howard S. (författare)
Nusbaum, Chad (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2009-09-09
2009
Engelska.
Ingår i: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 461:7262, s. 393-398
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Phytophthora infestans is the most destructive pathogen of potato and a model organism for the oomycetes, a distinct lineage of fungus-like eukaryotes that are related to organisms such as brown algae and diatoms. As the agent of the Irish potato famine in the mid-nineteenth century, P. infestans has had a tremendous effect on human history, resulting in famine and population displacement(1). To this day, it affects world agriculture by causing the most destructive disease of potato, the fourth largest food crop and a critical alternative to the major cereal crops for feeding the world's population(1). Current annual worldwide potato crop losses due to late blight are conservatively estimated at $6.7 billion(2). Management of this devastating pathogen is challenged by its remarkable speed of adaptation to control strategies such as genetically resistant cultivars(3,4). Here we report the sequence of the P. infestans genome, which at similar to 240 megabases (Mb) is by far the largest and most complex genome sequenced so far in the chromalveolates. Its expansion results from a proliferation of repetitive DNA accounting for similar to 74% of the genome. Comparison with two other Phytophthora genomes showed rapid turnover and extensive expansion of specific families of secreted disease effector proteins, including many genes that are induced during infection or are predicted to have activities that alter host physiology. These fast-evolving effector genes are localized to highly dynamic and expanded regions of the P. infestans genome. This probably plays a crucial part in the rapid adaptability of the pathogen to host plants and underpins its evolutionary potential.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

Biology
Biologi
effector proteins

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Haas, Brian J.
Kamoun, Sophien
Zody, Michael C.
Jiang, Rays H. Y ...
Handsaker, Rober ...
Cano, Liliana M.
visa fler...
Grabherr, Manfre ...
Kodira, Chinnapp ...
Raffaele, Sylvai ...
Torto-Alalibo, T ...
Bozkurt, Tolga O ...
Ah-Fong, Audrey ...
Alvarado, Lucia
Anderson, Vicky ...
Armstrong, Miles ...
Avrova, Anna
Baxter, Laura
Beynon, Jim
Boevink, Petra C ...
Bollmann, Stepha ...
Bos, Jorunn I. B ...
Bulone, Vincent
Cai, Guohong
Cakir, Cahid
Carrington, Jame ...
Chawner, Megan
Conti, Lucio
Costanzo, Stefan ...
Ewan, Richard
Fahlgren, Noah
Fischbach, Micha ...
Fugelstad, Johan ...
Gilroy, Eleanor ...
Gnerre, Sante
Green, Pamela J.
Grenville-Briggs ...
Griffith, John
Gruenwald, Nikla ...
Horn, Karolyn
Horner, Neil R.
Hu, Chia-Hui
Huitema, Edgar
Jeong, Dong-Hoon
Jones, Alexandra ...
Jones, Jonathan ...
Jones, Richard W ...
Karlsson, Elinor ...
Kunjeti, Sridhar ...
Lamour, Kurt
Liu, Zhenyu
Ma, LiJun
MacLean, Daniel
Chibucos, Marcus ...
McDonald, Hayes
McWalters, Jessi ...
Meijer, Harold J ...
Morgan, William
Morris, Paul F.
Munro, Carol A.
O'Neill, Keith
Ospina-Giraldo, ...
Pinzon, Andres
Pritchard, Leigh ...
Ramsahoye, Berna ...
Ren, Qinghu
Restrepo, Silvia
Roy, Sourav
Sadanandom, Ari
Savidor, Alon
Schornack, Sebas ...
Schwartz, David ...
Schumann, Ulrike ...
Schwessinger, Be ...
Seyer, Lauren
Sharpe, Ted
Silvar, Cristina
Song, Jing
Studholme, David ...
Sykes, Sean
Thines, Marco
van de Vondervoo ...
Phuntumart, Vipa ...
Wawra, Stephan
Weide, Rob
Win, Joe
Young, Carolyn
Zhou, Shiguo
Fry, William
Meyers, Blake C.
van West, Pieter
Ristaino, Jean
Govers, Francine
Birch, Paul R. J ...
Whisson, Stephen ...
Judelson, Howard ...
Nusbaum, Chad
visa färre...
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
Artiklar i publikationen
Nature
Av lärosätet
Uppsala universitet
Kungliga Tekniska Högskolan

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy