Tyck till om SwePub Sök här!
onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:139128740"
Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:139128740" > Contribution of all...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer
- Palin, K (författare)
- Pitkanen, E (författare)
- Turunen, M (författare)
- visa fler...
- Sahu, B (författare)
- Pihlajamaa, P (författare)
- Kivioja, T (författare)
- Kaasinen, E (författare)
- Valimaki, N (författare)
- Hanninen, UA (författare)
- Cajuso, T (författare)
- Aavikko, M (författare)
- Tuupanen, S (författare)
- Kilpivaara, O (författare)
- van den Berg, L (författare)
- Kondelin, J (författare)
- Tanskanen, T (författare)
- Katainen, R (författare)
- Grau, M (författare)
- Rauanheimo, H (författare)
- Plaketti, RM (författare)
- Taira, A (författare)
- Sulo, P (författare)
- Hartonen, T (författare)
- Sokolova, M (författare)
- Vaharautio, A (författare)
- Gladysz, K (författare)
- Ongen, H (författare)
- Dermitzakis, E (författare)
- Bramsen, JB (författare)
- Orntoft, TF (författare)
- Andersen, CL (författare)
- Ristimaki, A (författare)
- Lepisto, A (författare)
- Renkonen-Sinisalo, L (författare)
- Mecklin, JP (författare)
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2018-09-10
- 2018
- Engelska.
- Ingår i: Nature communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 9:1, s. 3664-
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Point mutations in cancer have been extensively studied but chromosomal gains and losses have been more challenging to interpret due to their unspecific nature. Here we examine high-resolution allelic imbalance (AI) landscape in 1699 colorectal cancers, 256 of which have been whole-genome sequenced (WGSed). The imbalances pinpoint 38 genes as plausible AI targets based on previous knowledge. Unbiased CRISPR-Cas9 knockout and activation screens identified in total 79 genes within AI peaks regulating cell growth. Genetic and functional data implicate loss of TP53 as a sufficient driver of AI. The WGS highlights an influence of copy number aberrations on the rate of detected somatic point mutations. Importantly, the data reveal several associations between AI target genes, suggesting a role for a network of lineage-determining transcription factors in colorectal tumorigenesis. Overall, the results unravel the contribution of AI in colorectal cancer and provide a plausible explanation why so few genes are commonly affected by point mutations in cancers.
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Palin, K
- Pitkanen, E
- Turunen, M
- Sahu, B
- Pihlajamaa, P
- Kivioja, T
- visa fler...
- Kaasinen, E
- Valimaki, N
- Hanninen, UA
- Cajuso, T
- Aavikko, M
- Tuupanen, S
- Kilpivaara, O
- van den Berg, L
- Kondelin, J
- Tanskanen, T
- Katainen, R
- Grau, M
- Rauanheimo, H
- Plaketti, RM
- Taira, A
- Sulo, P
- Hartonen, T
- Dave, K
- Schmierer, B
- Botla, S
- Sokolova, M
- Vaharautio, A
- Gladysz, K
- Ongen, H
- Dermitzakis, E
- Bramsen, JB
- Orntoft, TF
- Andersen, CL
- Ristimaki, A
- Lepisto, A
- Renkonen-Sinisal ...
- Mecklin, JP
- Taipale, J
- Aaltonen, LA
- visa färre...
- Artiklar i publikationen
- Nature communica ...
- Av lärosätet
- Karolinska Institutet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
