Distribution and Medical Impact of Loss-of-Function Variants in the Finnish Founder Population.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:8743af47-dbae-4236-8657-348ec9a939d3" > Distribution and Me...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Distribution and Medical Impact of Loss-of-Function Variants in the Finnish Founder Population.

Lim, Elaine T (författare)

Würtz, Peter (författare)

Havulinna, Aki S (författare)

visa fler...

Palta, Priit (författare)

Tukiainen, Taru (författare)

Rehnström, Karola (författare)

Esko, Tõnu (författare)

Mägi, Reedik (författare)

Inouye, Michael (författare)

Lappalainen, Tuuli (författare)

Chan, Yingleong (författare)

Salem, Rany M (författare)

Lek, Monkol (författare)

Flannick, Jason (författare)

Sim, Xueling (författare)

Manning, Alisa (författare)

Ladenvall, Claes (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Bumpstead, Suzannah (författare)

Hämäläinen, Eija (författare)

Aalto, Kristiina (författare)

Maksimow, Mikael (författare)

Salmi, Marko (författare)

Blankenberg, Stefan (författare)

Ardissino, Diego (författare)

Shah, Svati (författare)

Horne, Benjamin (författare)

McPherson, Ruth (författare)

Hovingh, Gerald K (författare)

Reilly, Muredach P (författare)

Watkins, Hugh (författare)

Goel, Anuj (författare)

Farrall, Martin (författare)

Girelli, Domenico (författare)

Reiner, Alex P (författare)

Stitziel, Nathan O (författare)

Kathiresan, Sekar (författare)

Gabriel, Stacey (författare)

Barrett, Jeffrey C (författare)

Lehtimäki, Terho (författare)

Laakso, Markku (författare)

Groop, Leif (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Kaprio, Jaakko (författare)

Perola, Markus (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

McCarthy, Mark I (författare)

Boehnke, Michael (författare)

Altshuler, David M (författare)

Lindgren, Cecilia A (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Hirschhorn, Joel N (författare)

Metspalu, Andres (författare)

Freimer, Nelson B (författare)

Zeller, Tanja (författare)

Jalkanen, Sirpa (författare)

Koskinen, Seppo (författare)

Raitakari, Olli (författare)

Durbin, Richard (författare)

MacArthur, Daniel G (författare)

Salomaa, Veikko (författare)

Ripatti, Samuli (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Daly, Mark (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

Palotie, Aarno (författare): Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups

visa färre...

(creator_code:org_t)

2014-07-31
2014
Engelska.
Ingår i: PLoS Genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7404. ; 10:7

Relaterad länk:: http://www.ncbi.nlm.... (free); visa fler...; http://dx.doi.org/10... (free); https://journals.plo...; https://lup.lub.lu.s...; https://doi.org/10.1...; visa färre...

Tidskriftsartikel (refereegranskat)

Abstract Ämnesord

Stäng

Exome sequencing studies in complex diseases are challenged by the allelic heterogeneity, large number and modest effect sizes of associated variants on disease risk and the presence of large numbers of neutral variants, even in phenotypically relevant genes. Isolated populations with recent bottlenecks offer advantages for studying rare variants in complex diseases as they have deleterious variants that are present at higher frequencies as well as a substantial reduction in rare neutral variation. To explore the potential of the Finnish founder population for studying low-frequency (0.5-5%) variants in complex diseases, we compared exome sequence data on 3,000 Finns to the same number of non-Finnish Europeans and discovered that, despite having fewer variable sites overall, the average Finn has more low-frequency loss-of-function variants and complete gene knockouts. We then used several well-characterized Finnish population cohorts to study the phenotypic effects of 83 enriched loss-of-function variants across 60 phenotypes in 36,262 Finns. Using a deep set of quantitative traits collected on these cohorts, we show 5 associations (p<5×10-8) including splice variants in LPA that lowered plasma lipoprotein(a) levels (P = 1.5×10-117). Through accessing the national medical records of these participants, we evaluate the LPA finding via Mendelian randomization and confirm that these splice variants confer protection from cardiovascular disease (OR = 0.84, P = 3×10-4), demonstrating for the first time the correlation between very low levels of LPA in humans with potential therapeutic implications for cardiovascular diseases. More generally, this study articulates substantial advantages for studying the role of rare variation in complex phenotypes in founder populations like the Finns and by combining a unique population genetic history with data from large population cohorts and centralized research access to National Health Registers.

Hitta via bibliotek

PLoS Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Lim, Elaine T; Würtz, Peter; Havulinna, Aki S; Palta, Priit; Tukiainen, Taru; Rehnström, Karol ...; visa fler...; Esko, Tõnu; Mägi, Reedik; Inouye, Michael; Lappalainen, Tuu ...; Chan, Yingleong; Salem, Rany M; Lek, Monkol; Flannick, Jason; Sim, Xueling; Manning, Alisa; Ladenvall, Claes; Bumpstead, Suzan ...; Hämäläinen, Eija; Aalto, Kristiina; Maksimow, Mikael; Salmi, Marko; Blankenberg, Ste ...; Ardissino, Diego; Shah, Svati; Horne, Benjamin; McPherson, Ruth; Hovingh, Gerald ...; Reilly, Muredach ...; Watkins, Hugh; Goel, Anuj; Farrall, Martin; Girelli, Domenic ...; Reiner, Alex P; Stitziel, Nathan ...; Kathiresan, Seka ...; Gabriel, Stacey; Barrett, Jeffrey ...; Lehtimäki, Terho; Laakso, Markku; Groop, Leif; Kaprio, Jaakko; Perola, Markus; McCarthy, Mark I; Boehnke, Michael; Altshuler, David ...; Lindgren, Cecili ...; Hirschhorn, Joel ...; Metspalu, Andres; Freimer, Nelson ...; Zeller, Tanja; Jalkanen, Sirpa; Koskinen, Seppo; Raitakari, Olli; Durbin, Richard; MacArthur, Danie ...; Salomaa, Veikko; Ripatti, Samuli; Daly, Mark; Palotie, Aarno; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

Artiklar i publikationen: PLoS Genetics

Av lärosätet: Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se

Distribution and Medical Impact of Loss-of-Function Variants in the Finnish Founder Population.

Ämnesord

Publikations- och innehållstyp

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Sök utanför SwePub