SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-102095"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-102095" > Pfam :

Pfam : the protein families database

Finn, Robert D. (författare)
Bateman, Alex (författare)
Clements, Jody (författare)
visa fler...
Coggill, Penelope (författare)
Eberhardt, Ruth Y. (författare)
Eddy, Sean R. (författare)
Heger, Andreas (författare)
Hetherington, Kirstie (författare)
Holm, Liisa (författare)
Mistry, Jaina (författare)
Sonnhammer, Erik L. L. (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
Tate, John (författare)
Punta, Marco (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2014
2014
Engelska.
Ingår i: Nucleic Acids Research. - 0305-1048 .- 1362-4962. ; 42:D1, s. d222-D230
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Pfam, available via servers in the UK (http://pfam.sanger.ac.uk/) and the USA (http://pfam.janelia.org/), is a widely used database of protein families, containing 14 831 manually curated entries in the current release, version 27.0. Since the last update article 2 years ago, we have generated 1182 new families and maintained sequence coverage of the UniProt Knowledgebase (UniProtKB) at nearly 80%, despite a 50% increase in the size of the underlying sequence database. Since our 2012 article describing Pfam, we have also undertaken a comprehensive review of the features that are provided by Pfam over and above the basic family data. For each feature, we determined the relevance, computational burden, usage statistics and the functionality of the feature in a website context. As a consequence of this review, we have removed some features, enhanced others and developed new ones to meet the changing demands of computational biology. Here, we describe the changes to Pfam content. Notably, we now provide family alignments based on four different representative proteome sequence data sets and a new interactive DNA search interface. We also discuss the mapping between Pfam and known 3D structures.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy