SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-49696"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-49696" > The Pfam protein fa...

The Pfam protein families database

Finn, Robert D. (författare)
Mistry, Jaina (författare)
Tate, John (författare)
visa fler...
Coggill, Penny (författare)
Heger, Andreas (författare)
Pollington, Joanne E. (författare)
Gavin, O. Luke (författare)
Gunasekaran, Prasad (författare)
Ceric, Goran (författare)
Forslund, Kristoffer (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
Holm, Liisa (författare)
Sonnhammer, Erik L. L. (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik
Eddy, Sean R. (författare)
Bateman, Alex (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2010
2010
Engelska.
Ingår i: Nucleic Acids Research. - 0305-1048 .- 1362-4962. ; 38, s. d211-d222
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Pfam is a widely used database of protein families and domains. This article describes a set of major updates that we have implemented in the latest release (version 24.0). The most important change is that we now use HMMER3, the latest version of the popular profile hidden Markov model package. This software is similar to 100 times faster than HMMER2 and is more sensitive due to the routine use of the forward algorithm. The move to HMMER3 has necessitated numerous changes to Pfam that are described in detail. Pfam release 24.0 contains 11 912 families, of which a large number have been significantly updated during the past two years. Pfam is available via servers in the UK (http://pfam.sanger.ac.uk/), the USA (http://pfam.janelia.org/) and Sweden (http://pfam.sbc.su.se/).

Nyckelord

NATURAL SCIENCES
NATURVETENSKAP

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy