SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ab111aca-769a-4d9f-92c5-9231ec557d24"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ab111aca-769a-4d9f-92c5-9231ec557d24" > Leveraging cross-sp...

Leveraging cross-species transcription factor binding site patterns: from diabetes risk Loci to disease mechanisms.

Claussnitzer, Melina (författare)
Dankel, Simon N (författare)
Klocke, Bernward (författare)
visa fler...
Grallert, Harald (författare)
Glunk, Viktoria (författare)
Berulava, Tea (författare)
Lee, Heekyoung (författare)
Oskolkov, Nikolay (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Fadista, Joao (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Ehlers, Kerstin (författare)
Wahl, Simone (författare)
Hoffmann, Christoph (författare)
Qian, Kun (författare)
Rönn, Tina (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics
Riess, Helene (författare)
Müller-Nurasyid, Martina (författare)
Bretschneider, Nancy (författare)
Schroeder, Timm (författare)
Skurk, Thomas (författare)
Horsthemke, Bernhard (författare)
Spieler, Derek (författare)
Klingenspor, Martin (författare)
Seifert, Martin (författare)
Kern, Michael J (författare)
Mejhert, Niklas (författare)
Karolinska Institutet
Dahlman, Ingrid (författare)
Karolinska Institutet
Hansson, Ola (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Hauck, Stefanie M (författare)
Blüher, Matthias (författare)
Arner, Peter (författare)
Karolinska Institutet
Groop, Leif (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Illig, Thomas (författare)
Suhre, Karsten (författare)
Hsu, Yi-Hsiang (författare)
Mellgren, Gunnar (författare)
Hauner, Hans (författare)
Laumen, Helmut (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2014
2014
Engelska.
Ingår i: Cell. - : Elsevier BV. - 1097-4172 .- 0092-8674. ; 156:1-2, s. 343-358
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genome-wide association studies have revealed numerous risk loci associated with diverse diseases. However, identification of disease-causing variants within association loci remains a major challenge. Divergence in gene expression due to cis-regulatory variants in noncoding regions is central to disease susceptibility. We show that integrative computational analysis of phylogenetic conservation with a complexity assessment of co-occurring transcription factor binding sites (TFBS) can identify cis-regulatory variants and elucidate their mechanistic role in disease. Analysis of established type 2 diabetes risk loci revealed a striking clustering of distinct homeobox TFBS. We identified the PRRX1 homeobox factor as a repressor of PPARG2 expression in adipose cells and demonstrate its adverse effect on lipid metabolism and systemic insulin sensitivity, dependent on the rs4684847 risk allele that triggers PRRX1 binding. Thus, cross-species conservation analysis at the level of co-occurring TFBS provides a valuable contribution to the translation of genetic association signals to disease-related molecular mechanisms.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Cell (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy